{"id":22893,"date":"2012-07-20T13:54:59","date_gmt":"2012-07-20T17:54:59","guid":{"rendered":"http:\/\/blogviejo.sld.cu\/marionod\/?p=22893"},"modified":"2012-07-20T13:54:59","modified_gmt":"2012-07-20T17:54:59","slug":"animal-toxin-database","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/blogs.sld.cu\/marionod\/2012\/07\/20\/animal-toxin-database\/","title":{"rendered":"Animal Toxin Database"},"content":{"rendered":"<p><a href=\"http:\/\/protchem.hunnu.edu.cn\/toxin\/index.jsp\" target=\"_blank\">Animal Toxin Database<\/a><\/p>\n<div dir=\"ltr\">\n<div><span><span lang=\"es\">El <\/span><\/span>Laboratorio de Bioqu\u00edmica del Colegio de Ciencias de la Vida de la Universidad Normal de Hunan, en China ha publicado esta base de datos. <span><span lang=\"es\">Las toxinas animales, como arsenal de los animales venenosos, son  productos de la selecci\u00f3n natural en millones de a\u00f1os y han demostrado ser  herramientas valiosas en investigaciones b\u00e1sicas y cl\u00ednicas. <\/span><span lang=\"es\">ATDB es el m\u00e1s completo repositorio de toxinas animales en el  mundo. <\/span><span lang=\"es\">Ahora, se publica  ATDB 2.0. <\/span><span lang=\"es\">Se centra principalmente en la construcci\u00f3n de una red de  interacci\u00f3n de canales de toxina-animal a escala mundial\u00a0 basada en la literatura y  anotaciones en base de datos. <\/span><span lang=\"es\">Para ello, se integr\u00f3 una base de datos del canal i\u00f3nico en  ATDB 2.0, en que la mayor\u00eda de las secuencias de canal de <\/span><\/span>iones <span><span lang=\"es\">fueron categorizados y  anotados con un sistema jer\u00e1rquico de t\u00e9rminos controlados (ontolog\u00eda de canal de iones). <\/span><span lang=\"es\">M\u00e1s de 55.022 interacciones <\/span><\/span>posibles <span><span lang=\"es\">de T-C fueron extra\u00eddas por  la miner\u00eda de texto que vinculan a la toxina con la base de datos del canal\u00a0 i\u00f3nico. <\/span><span lang=\"es\">Estos datos de interacci\u00f3n fueron clasificados cuidadosamente  basados en el tipo de evidencia en que fueron anotadas 9.193 interacciones de  alta confianza en nivel de sitio activo. <\/span><span lang=\"es\">Una red de interacci\u00f3n <\/span><\/span>T-C <span><span lang=\"es\">basada en la web fu\u00e9  construida para visualizar y facilitar el acceso a los datos. <\/span><span lang=\"es\">Las nuevas caracter\u00edsticas y actualizaciones de ATDB 2.0 se  resumen como sigue:<\/span><\/span><\/div>\n<div><span lang=\"es\">1.  Un nuevo conjunto de datosde\u00a0 interacci\u00f3n incluyendo <\/span>55.022 <span lang=\"es\">interacciones de toxina-canal<br \/>\n<\/span><\/div>\n<div><span lang=\"es\">2. Una nuevabas de datos\u00a0 de canal de iones (5.097 entradas)<\/span><\/div>\n<div><span lang=\"es\">3.  Una nueva ontolog\u00eda para la clasificaci\u00f3n del canal i\u00f3nico (Ion Channel  ontology)<\/span><\/div>\n<div><span lang=\"es\">4.3000 mapas  para toxinas y la interacci\u00f3n de canales de iones<\/span><\/div>\n<div><span lang=\"es\">5. M\u00e1s de 600 nuevas entradas  de toxinas<\/span><\/div>\n<div><span lang=\"es\">6. Vista PDB  para visualizar la estructura tridimensional de la mol\u00e9cula<\/span><\/div>\n<div><span lang=\"es\">7. M\u00e1s flexible opci\u00f3n  para descargas de datos.<\/span><\/div>\n<div><\/div>\n<div><span lang=\"es\">Idioma: ingl\u00e9s<br \/>\n<\/span><\/div>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Animal Toxin Database El Laboratorio de Bioqu\u00edmica del Colegio de Ciencias de la Vida de la Universidad Normal de Hunan, en China ha publicado esta base de datos. 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