El Laboratorio de Bioquímica del Colegio de Ciencias de la Vida de la Universidad Normal de Hunan, en China ha publicado esta base de datos. Las toxinas animales, como arsenal de los animales venenosos, son productos de la selección natural en millones de años y han demostrado ser herramientas valiosas en investigaciones básicas y clínicas. ATDB es el más completo repositorio de toxinas animales en el mundo. Ahora, se publica ATDB 2.0. Se centra principalmente en la construcción de una red de interacción de canales de toxina-animal a escala mundial basada en la literatura y anotaciones en base de datos. Para ello, se integró una base de datos del canal iónico en ATDB 2.0, en que la mayoría de las secuencias de canal de iones fueron categorizados y anotados con un sistema jerárquico de términos controlados (ontología de canal de iones). Más de 55.022 interacciones posibles de T-C fueron extraídas por la minería de texto que vinculan a la toxina con la base de datos del canal iónico. Estos datos de interacción fueron clasificados cuidadosamente basados en el tipo de evidencia en que fueron anotadas 9.193 interacciones de alta confianza en nivel de sitio activo. Una red de interacción T-C basada en la web fué construida para visualizar y facilitar el acceso a los datos. Las nuevas características y actualizaciones de ATDB 2.0 se resumen como sigue:
1. Un nuevo conjunto de datosde interacción incluyendo 55.022 interacciones de toxina-canal
2. Una nuevabas de datos de canal de iones (5.097 entradas)
3. Una nueva ontología para la clasificación del canal iónico (Ion Channel ontology)
4.3000 mapas para toxinas y la interacción de canales de iones
5. Más de 600 nuevas entradas de toxinas
6. Vista PDB para visualizar la estructura tridimensional de la molécula
7. Más flexible opción para descargas de datos.
Idioma: inglés
