Patógenos

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Multi Locus Sequence Typing Databases

El propósito principal de la Multi Locus Sequence Typing es la tipificación molecular y la epidemiología de los patógenos bacterianos y otros microorganismos y para la investigación de su biología evolutiva y de la población.
Los sitios web y bases de datos en www.mlst.net se encuentran en el Departamento de Epidemiología de Enfermedades Infecciosas del Colegio Imperial de Londres; las bases de datos de MLST para otras especies de microbios se mantienen en el edificio de Peter Medawar de Investigación
de Patógenos de la Universidad de Oxford y el Instituto Max Planck– Institut für Infektionsbiologie MPI, Berlín.

Los microorganismos patógenos que se relacionan su datos son los siguientes:

B.burgdorferi
B.cereus
B.pseudomallei
C.albicans
C.glabrata
C.krusei
C.tropicalis
C.jejuni
C.neoformans var grubii
E.coli
E.faecalis
E.faecium
H.influenzae
H.pylori
Leptospira spp.
M.catarrhalis
N.meningitidis
S.agalactiae
S.aureus
S.enterica
S.epidermidis
S.pneumoniae
S.pyogenes
S.suis
V.vulnificus

Idioma: inglés

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PATRIC

En Septiembre de 2009, el Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas (NIAID), como parte de los Institutos Nacionales de Salud (NIH), otorgó un contrato de 5 años para la División Ciberinfraestructura Virginia Tech, para apoyar la labor de la comunidad de investigación biomédica en enfermedades infecciosas. Esta financiación se utilizó para integrar la información vital sobre los patógenos, de proporcionar recursos y herramientas claves para los científicos, y ayudar a los investigadores para analizar los datos genómicos, proteómicos y otros derivados de la investigación de enfermedades infecciosas. El nuevo contrato apoyó el desarrollo de los recursos del Centro de Integración de Patosistemas  (Patric), el suministro de datos ricos y herramientas de análisis para todas las especies de bacterias en la categoría seleccionada de la Lista priorizada A-C de patógenos de la NIAID . Además, esta División continúa utilizando su modelo de amplia colaboración con las diversas comunidades científicas de todo el mundo para descubrir conjuntamente nuevos conocimientos biológicos, así como enfocarse internamente en la investigación biológica y el análisis de datos están en una posición única para desarrollar.
El proyecto Patric incluye tres colaboradores principales: la Universidad de Chicago, la Universidad de Manchester, y los
Nueva medios de comunicación de la ciudad.

La relación de bacterias que esta base de datos muestra son:

  • Bacillus
  • Bartonella
  • Borrelia
  • Brucella
  • Burkholderia
  • Campylobacter
  • Chlamydophila
  • Clostridium
  • Coxiella
  • Ehrlichia
  • Escherichia
  • Francisella
  • Helicobacter
  • Listeria
  • Mycobacterium
  • Rickettsia
  • Salmonella
  • Shigella
  • Staphylococcus
  • Streptococcus
  • Vibrio
  • Yersinia

Idioma: inglés

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EuPathDB

Esta base de datos sobre microorganismos patógenos eukarióticos está patrocinada por el Instituto Nacional  de Alergia y Enfermedades Infecciosas de Estados Unidos y administrada por el Instituto de Bioinformática de Virginia , el cual diseña, desarrolla y mantiene sus bases de datos integrantes: AmoebaDB, CryptoDB, GiardiaDB, MicrosporidiaDB, PlasmoDB, ToxoDB, TrichDB y TriTrypDB (que es soportada por la Fundación Bill and Melinda Gates) que corresponden a tipos de datos y genomas de los microorganismos: Amebas, Cryptosporidium, Giardia Lamblia, Microsporidia, Plasmodium, Toxoplasm, Trichomonas, y  Trypanosoma. Idioma: inglés

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Allergy Frontiers: Classification and Pathomechanisms. Springer 2009. Pathogen Recognition and New Insights into Innate Immunity

La editorial Springer brinda un capítulo de muestra de su libro¨Fronteras de Alergia: Clasificación y Patomecanismos¨ que trata del reconocimiento de patógenos y nuevas informaciones sobre la inmunidad innata. Idioma: inglés