Bioinformática

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Journal of Integrative Bioinformatics

Revista a texto completo y arbitrada de la editorial De Gruyter que publica artículos de investigación originales en todos los aspectos de la bioinformática integradora.
La biología molecular produce grandes cantidades de datos en la era post-genómica. Esto incluye datos que describen mecanismos metabólicos y vías, organización genómica estructural, patrones de regiones reguladoras; proteómica, transcriptómica y metabolómica. Por un lado, el análisis de estos datos utiliza esencialmente los métodos y conceptos de informática; por otro lado, la gama de tareas biológicas resueltas por los investigadores determina el alcance y el alcance de los datos. Actualmente, hay alrededor de 1,000 sistemas de bases de datos y varias herramientas analíticas disponibles a través de Internet que están dirigidas a resolver diversas tareas biológicas.
El desafío que tenemos es integrar estas listas de partes y relaciones de la genómica y la proteómica en nuevos niveles de comprensión. La revista es una nueva área de investigación que utiliza las herramientas de la informática y la infraestructura electrónica aplicada a la biotecnología. Estas herramientas también representarán la columna vertebral del concepto de una celda virtual. Idioma: inglés

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Journal of Bioinformatics and Genomics

Revista a texto completo y arbitrada que tiene el objetivo de publicar artículos científicos originales y revisión de alto impacto en el campo de la genética y la bioinformática, incluyendo:

     Nuevas tecnologías genómicas
Epigenética
Investigación en Biología usando computación
Herramientas bioinformáticas para interrogar y modelar fenómenos biológicos
Nuevas herramientas computacionales y bases de datos
Análisis del genoma
Análisis de secuencia
Filogenia
Bioinformática estructural
La expresion genica
Análisis genético y de población
Biología de sistemas
Minería de datos y texto
Bases de datos y ontologías
Informática de Bioimagen
 La revista recibe presentaciones que:
Proporcionen investigaciones interesantes que incluyan la intersección entre Experimentación y Computación en Biología y Bio-Medicina
Usen conjuntos de datos a gran escala, a nivel de sistema y de alto rendimiento para derivar nuevos conocimientos biológicos que no se obtienen fácilmente con otros enfoques
Reportar nuevos algoritmos para el análisis de datos de alto rendimiento
La revista está particularmente interesada en trabajos que respondan preguntas de larga data, que abran nuevas vías de investigación, informen hallazgos inesperados o cambien la forma en que pensamos sobre los procesos biológicos. Idioma: inglés
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Big Data Analytics

Revista a texto completo y arbitrada de la editorial BioMed Central que acoge con agrado artículos de vanguardia que describen el trabajo básico y aplicado original que incluye cuentas computacionales de inspiración biológica de todos los aspectos del análisis de grandes datos analíticos de las ciencias. Abarcando las ciencias de la vida, las ciencias sociales, la ingeniería, las ciencias físicas y matemáticas, Big Data Analytics pretende proporcionar una plataforma para la difusión de la investigación, las prácticas actuales y las tendencias futuras en la disciplina emergente de análisis de grandes datos.

Big Data Analytics invita a artículos de investigación originales de alta calidad y revisiones oportunas sobre los desarrollos actuales en el campo, cubriendo todos los aspectos del análisis de grandes datos, incluyendo pero no limitado a los siguientes temas:

Enfoques algorítmicos, teóricos y computacionales tales como redes de aprendizaje profundo, computación cognitiva inspirada en la naturaleza y inspirada en el cerebro, análisis estadístico y matemático, visualización e informática.
Implementaciones y plataformas como neuromorfos, GPUs, clusters y nubes, y software de código abierto.
Aplicaciones en ámbitos tan diversos como la genómica, la medicina, la salud, la clínica, la biología y la neuroinformática, la robótica natural, el procesamiento del lenguaje, la meteorología, la geociencia, la inteligencia empresarial y multimedia, Vigilancia, transporte, energía, gestión energética y económica, búsqueda en Internet, biológicas, químicas, físicas, medioambientales, oceánicas y planetarias, y ciencias electrónicas en general.
Big Data Analytics considera los siguientes tipos de artículos: Investigación, Comentario, Informe de la reunión, Metodología, Revisión y Software. Idioma: inglés

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D-Scholarship@Pitt.Thesis and Dissertations

El repositorio institucional de la Universidad de Pittsburgh ha publicado esta colección de tesis y disertaciones sobre distintos temas relacionados con las ciencias de la salud y las ciencias de la información:

Idioma: inglés

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VectorBase

VectorBase es un Centro de Recursos de Bioinformática (BRC) centrado en vectores invertebrados de las enfermedades humanas. VectorBase es uno de los cuatro Centros de Recursos Bioinformática financiados por el NIAID para proporcionar los recursos basados ​​en la web para la comunidad científica la realización de investigación básica y aplicada sobre los organismos considerados potenciales agentes de guerra biológica o el bioterrorismo o causar enfermedades emergentes o reemergentes. Este proyecto ha sido financiado con fondos federales del Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas de los Institutos Nacionales de Salud, Departamento de Salud y Servicios Humanos,. Idioma: inglés

Nota: para acceder a los contenidos de esta base de datos es necesario registrarse previamente de forma gratuita

TICdb

Base de datos de puntos de interrupción de translocación en el cáncer. Esta actualización contiene 1374 secuencias de fusión que se encuentran en los tumores humanos, con la participación de 431 genes diferentes.
Para cada fusión, TICdb devolverá el nombre HGNC de ambos genes asociados y la referencia original (ya sea un GenBank o un ID de PubMed), así como la secuencia de fusión.
Puede buscar en TICdb cualquier alias de genes disponibles en Entrez Gene. Puede descargar aquí un archivo de texto separado por tabuladores con todas las fusiones incluidos en esta actualización.

Ha sido elaborada por el Departmento de Bioquímica y Genética de  las Facultades de Ciencias de la Universidad de Navarra

Idioma: inglés

Genomics, Proteomics & Bioinformatics

Revista a texto completo y arbitrada del Instituto de Genómica de  Beijing, Academia China de Ciencias y la Sociedad Genética de China y publicada por la editorial Elsevier, con filosofía Open Access,  que ofrece los trabajos mundiales en los campos de la genómica, proteómica y bioinformática.
Las áreas presentadas y de particular interés de GPB incluyen, pero no se limitan con:
• Genómica
• Proteómica
• Bioinformática
GPB da la bienvenida a sumisiones de todo el mundo en los tipos siguientes:
• Trabajos de investigación de alta calidad que presenten datos  e ideas nuevas
• Trabajos que describan métodos , instrumentos y técnicas innovadoras así como recursos que proporcionen información científica primaria a un amplio número de lectores
• Los análisis exhaustivos como artículos completos o como minirevisiones relacionados con la propia investigación del autor
• Comentarios y opiniones sobre nuevos descubrimientos, políticas científicas y ofertas de investigación.

Idioma: inglés

Journal of Integrative Bioinformatics

Revista a texto completo y arbitrada de la editorial MBio e.V. que publica artículos de investigación en todos los aspectos de la bioinformática integrativa principalmente en:

  • bases de datos biológicas moleculares y aplicaciones;
  • integración de conjuntos de datos  biológicos moleculares, médicos y otros relacionados  relevantes para sistemas biológicos;
  • integración de aplicaciones  biológicas moleculares, médicas y otras relacionadas  relevantes para sistemas biológicos;
  • diseño de redes metabólicas reguladoras y de expresión;
  • estudios interdisciplinarios de estas redes metabólicas;
  • evaluación de datos experimentales originales con instrumentos biocomputacionles;
  • recursos en línea para científicos experimentales.

Idioma: inglés

Vedic Research International Bioinformatics & Proteomics

Revista científica internacional, a texto completo y arbitrada, de frecuencia trimestral (4 números al año), de la editorial Vedic Research International, publica todas las áreas de bioinformática, químicainformática,  informática médica. Se aceptan en general todas las áreas de la bioinformática y proteómica, es decir, la bioinformática, microarrays, expresión génica, NGS, proteómica, diseño de fármacos, química y médica informática.
VRI-Bioinformática y Proteómica publica artículos regulares de investigación, cartas al editor, comunicaciones cortas, mini críticas y comentarios que se ocupende todos los aspectos del uso de la biología computacional. VRI-Bioinformática y Proteómica está alentando a los científicos a publicar los datos experimentales tan elaborados como sea posible. Idioma: inglés

MITOMAP. A human mitochondrial genome database

Plataforma bioinformática que colecciona informes publicados y datos inéditos sobre la variación mitocondrial humana del ADN. La mayor parte de los datos son curados manualmente y, debido al volumen masivo de ordenar los datos que son producidos por todo el mundo, hay siempre una reserva de trabajos y de los datos que se agregarán. Forma parte del Centro para la Medicina Mitocondrial y Epigenómica de Doug Wallace en el Hospital del Niño de  Philadelphia. Idioma: inglés