Bioinformática

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Alfred Winter , Elske Ammenwerth , Reinhold Haux , Michael Marschollek , Bianca Steiner , Franziska Jahn. Health Information Systems. Technological and Management Perspectives. Springer Cham 2023

Libro en acceso abierto de la editorial Springer que:

Considera los sistemas de información en una variedad de situaciones
Detalla las capas de dominio, herramienta lógica y herramienta física de los sistemas de información de salud
Cubre los aspectos estratégicos, tácticos y de gestión operativa de los sistemas de información sanitaria
Incluye detalles sobre los sistemas de información en la investigación médica

Esta edición ofrece una visión completa de las tecnologías disponibles para reunir, gestionar y evaluar la calidad de los sistemas de información sanitaria. Detalla una variedad de escenarios en el contexto de la salud y la atención médica, incluso cuando se relacionan la prevención y el bienestar, como el tratamiento de enfermedades agudas y crónicas. También se describen los requisitos de las partes interesadas para proporcionar perspectivas para describir las arquitecturas y técnicas de gestión asociadas con los sistemas de información de salud, lo que permite al lector desarrollar una visión holística detallada del tema.
El libro presenta una descripción detallada de cómo se pueden administrar los sistemas de información en el cuidado de la salud y es un recurso vital para los estudiantes de informática médica que buscan un texto actualizado sobre el tema. Idioma: inglés

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JMIR Bioinformatics and Biotechnology

Revista a texto completo y arbitrada de la editorial JMIR Publications, cuyo objetivo es centrarse en las aplicaciones bioinformáticas dentro del campo de la informática médica.
La revista que se centra en bioinformática, algoritmos y herramientas de detección de variación genómica, aplicaciones de IA en genómica e informática de patología, modelado matemático en sistemas biológicos, visualización de datos genómicos, biología de redes y análisis de datos genómicos del cáncer.
JMIR Bioinformatics and Biotechnology apoya la investigación interdisciplinaria y da la bienvenida a las contribuciones que amplían los límites de la bioinformática, la genómica, la inteligencia artificial y la informática de patología.
El alcance de la revista incluye el desarrollo y la aplicación de algoritmos y herramientas de detección de variación genómica, incluida la secuenciación de células individuales y la transcriptómica espacial; modelos predictivos basados en IA; informática de patología, incluido el análisis de imágenes; modelación matemática en sistemas biológicos, incluida la administración y el descubrimiento de fármacos; visualización de datos genómicos; biología de redes; y análisis de datos genómicos del cáncer. JMIR Bioinformatics and Biotechnology será una plataforma para colaboraciones interdisciplinarias entre bioinformáticos, biólogos, informáticos, matemáticos y clínicos para abordar los desafíos de integrar datos genómicos a gran escala con información clínica y patológica. La revista da la bienvenida a artículos de investigación originales, artículos de revisión y perspectivas, así como presentaciones sobre avances metodológicos y herramientas computacionales en estas áreas. Idioma. inglés

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Bioinformatics

Revista a texto completo y arbitrada de la editorial Oxford University Press, el cual brinda un forum para el intercambio de información en los campos de biología molecular computacional y bioinformática del genoma, con énfasis sobre nuevos algoritmos y bases de datos que avancen el progreso de la bioinformática y la investigación biomédica en una manera significativa.
En el sometimiento de sus trabajos el autor deberá seleccionar una de las siguines categorías para su manuscrito:
Análisis de genoma
Análisis de secuencia
Filogenética
Bioinformática estructural
Expresión de genes
Genética y análisis de población
Biología de sistemas
Datos y minería de textos
Base de datos y ontologías
Informática de bioimagen

Tipos de manuscritos:Trabajos originales, Notas de aplicación
Revisiones
Cartas al editor
Trabajos de conferencias.

Idioma: inglés

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Molecular and Cellular Probes

MCP—Advancing Biology and Medicine a través de Omics y Bioinformática Tecnologías quiere capturar los resultados de la revolución actual en tecnologías y ciencias moleculares. La revista ha ampliado su alcance y abarca cualquier trabajo de investigación y revisión de alta calidad en áreas que incluyen, entre otras, biología molecular; biología celular; bioquímica; fisiología molecular; genética; biología evolutiva; genómica (incluida la metagenómica); proteómica; metabolómica; glucómica y lipidómica, cáncer; hematología y oncohematología; epidemiología médica y veterinaria; inmunología; virología; microbiología; vacunología; diagnóstico molecular de enfermedades no infecciosas, infecciosas y parasitarias; y modelos animales en la investigación biomédica.
Se alientan particularmente las presentaciones con un enfoque impulsado por la tecnología para comprender los procesos normales de desarrollo biológico o de enfermedades, así como los avances conceptuales y los cambios de paradigma. Damos la bienvenida especialmente a los trabajos relacionados con la aplicación revolucionaria de la biopsia líquida y la secuenciación metagenómica de próxima generación en la detección de diferentes enfermedades y el seguimiento de los regímenes de tratamiento de los pacientes mediante el uso de exosomas y ácidos nucleicos libres de células (ADN, ADNmt, ARNm, microARN, ARN largo no codificante, ARN circular, etc.). Los estudios sobre ácidos nucleicos extracelulares en condiciones normales y patológicas y el tratamiento de enfermedades son el foco de MCP. Los estudios clínicos puros y la investigación basada en hipótesis también son adecuados (por ejemplo, la aplicación clínica de metabolómica / proteómica / transcriptómica utilizando muestras humanas). Solo se aceptarán trabajos bioinformáticos con confirmación experimental comprobada.
La investigación y los manuscritos de alta calidad se acelerarán. Un consejo editorial internacional altamente citado asegura la publicación oportuna de los manuscritos.
En general, los artículos de revisión enviados a la revista deben realizarse por invitación del Editor en Jefe
Molecular and Cellular Probes se ha convertido en un foro único para la investigación sobre la localización, el diagnóstico y el monitoreo de enfermedades hereditarias e infecciosas utilizando técnicas genómicas, proteómicas e inmunológicas. Cruzando los límites tradicionales de la medicina diagnóstica y clínica, la revista proporciona un punto de encuentro común invaluable para los trabajadores de una variedad de campos.
Se presta especial atención a los artículos relacionados con la genética molecular humana y las enfermedades infecciosas, que incluyen:

Aplicaciones de secuenciación de alto rendimiento
Descripción, aplicación y evaluación clínica de técnicas de biología molecular
Métodos biológicos moleculares aplicados a las enfermedades infecciosas
caracterización del microbioma humano (por ejemplo, mediante pirosecuenciación)
Metagenómica, metaproteómica y diversidad microbiana
Factores de riesgo en trastornos multifactoriales mediante polimorfismos de ADN
Detección de mutaciones en trastornos monogénicos
Diagnóstico prenatal y detección de portadores de trastornos hereditarios mediante tecnología molecular
Estudios moleculares en animales, especialmente con relevancia para la enfermedad humana
Impacto de la genómica en la medicina veterinaria
Descubrimiento de marcadores por proteómica para el diagnóstico de enfermedades
Perfil y secuenciación de proteínas para la discriminación bacteriana
Caracterización y detección de patógenos virales de humanos y animales mediante técnicas moleculares

Tipos de artículos: Trabajos de investigación originales de alta calidad, Notas/Comunicaciones breves. Idioma: inglés

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BioMedInformatics

Revista internacional a texto completo y arbitrada de frecuencia trimestral de la editorial MDPI AG, dedicada a todas las áreas de la informática biomédica, también como la biología y medicina computacional.
La misión de la revista es promover la investigación multidisciplinaria y los enfoques educativos que son esenciales para la ciencia computacional en biología y medicina. Presenta métodos y resultados basados en la informática y campos relacionados que permiten la extracción de información de datos biomédicos y la transferencia de esta información al conocimiento, promoviendo así enfoques científicos basados en datos. El enfoque de BioMedInformatics está en métodos novedosos y flujos de trabajo computacionales para soluciones basadas en datos a problemas biomédicos, y el peso de este enfoque es al menos igual al de informar sobre los resultados biomédicos específicos obtenidos actualmente con estos métodos.
Alcance
Acepta manuscritos sobre todos los aspectos de la informática biomédica y la biología computacional, y atención médica de todos los campos biomédicos, incluyendo anatomía, biomodelado, biología del cáncer, biología evolutiva, genómica, neurociencia, neuropsiquiatría, farmacia y farmacología, farmacometría y medicina fisiológica.
Los temas de interés incluyen, pero no se limitan a:

Bioinformática

Análisis del genoma y secuencia;
Expresión génica y proteica;
Genética y análisis poblacional;
Genómica comparativa;
Genómica funcional computacional;
Dinámica y función de las proteínas;
Minería de datos y textos;
Bases de datos y ontologías;
Análisis y modelado de sistemas complejos;
Aprendizaje automático e inteligencia artificial en bioinformática;
Análisis de redes;
Informática traslacional.

Informática Clínica

Aplicaciones clínicas de la informática en todos los campos médicos;
Diseños e implementaciones de sistemas clínicos;
Big data clínico;
Genómica en la atención clínica;
Ómicas en la atención clínica;
Informática de ensayos clínicos.

Informática de imágenes

Sistema de archivo y comunicación de imágenes (PACS);
Sistema de información radiológica;
Diagnóstico asistido por ordenador (CAD);
Visualización de tejidos 3D;
Imagen funcional en biomedicina;
Aprendizaje automático e inteligencia artificial en imágenes médicas.

Informática de Salud Pública

Informática de salud del consumidor;
Registros de atención médica;
Sistemas de información hospitalaria;
Sistemas de registro nacionales o internacionales y sistemas de historia clínica electrónica.

Biología Computacional y Medicina

Desarrollo y aplicación de datos: métodos analíticos y teóricos;
Modelización matemática;
Técnicas de simulación computacional;
Biología de sistemas.

Ciencia de datos farmacológicos

Farmacometría computacional y basada en modelado;
Farmacología de sistemas computacionales;
Descubrimiento, diseño y desarrollo de fármacos asistidos por computadora;
Ómicas para el descubrimiento y reutilización de fármacos.

Documentos metodológicos sobre ciencia de datos, con la presentación explícita de su utilidad para conjuntos de datos biomédicos, incluyendo

Enfoques estructurales y cuantitativos para la clasificación, agrupación y reconocimiento de patrones;
Modelado de datos complejos, minería de grandes conjuntos de datos;
Descubrimiento de conocimiento en bases de conocimiento biomédico y conjuntos de datos.

Idioma: inglés

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iMeta

Revista multimedia a texto completo y arbitrada de la editorial John Wiley & Sons que une la metagenómica y la investigación bioinformática. Publicada en nombre de iMeta Science es lanzada por científicos de la Academia China de Ciencias. La revista tiene como objetivo promover el desarrollo de la metagenómica y la bioinformática mediante la publicación de investigaciones originales, métodos o protocolos reproducibles y revisiones sistémicas. El objetivo es publicar artículos de alto impacto con una amplia gama de lectores y proporcionar a los pares hallazgos novedosos, herramientas de análisis fáciles de usar y conocimiento sistemático.
Alcance
• Microbioma en humanos, animales, plantas y medio ambiente
• Desarrollo y aplicación de métodos/protocolos meta-ómicos
• Herramientas, pipelines, bases de datos y paquetes bioinformáticos
• Revisión sistemática en metagenómica, bioinformática y microbioma
iMeta da la bienvenida a las presentaciones en los siguientes tipos de artículos: Artículo de investigación, Comunicación corta, Artículo de revisión, Perspectiva, Método y protocolo, Editorial, Anuncio, Comentario y Correspondencia.
Idioma: inglés

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NAR Genomics and Bioinformatics

Revista interdisciplinaria a texto completo y arbitrada de la editorial Oxford University Press, enfocada sobre analísis de datos a larga escala de genómica y bioinformática
Tiene el propósito de brindar a la comunidad con resultados de alta calidad, análisis y métodos en todos los aspectos de la genómica y la bioinformática, incluyendo nuevos métodos computacionales o experimentales y nuevos hallazgos biológicos relacionados a la genómica, proteómica, transcriptómica y epigenética. Idioma: inglés

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Bioinformatics Advances

Revista a texto completo y arbitrada publicada conjuntamente por la editorial Oxford University Press y por la Sociedad Internacional de Biología Computacional
La revista publica artículos de investigación originales, revisiones, notas de aplicación, opinión, perspectiva y características de la sociedad.

Alcance

Bioinformatics Advances es una revista interdisciplinaria sobre bioinformática y biología computacional. La revista cubre métodos bioinformáticos, como algoritmos, estadísticas, bases de datos y software, así como contribuciones biológicas para las cuales la aplicación de métodos computacionales avanzados es un factor esencial. El enfoque principal de la revista está en los niveles moleculares y celulares de la biología. La revista cubre la bioinformática tanto para enfoques experimentales establecidos como para tecnologías emergentes que requieren un soporte computacional innovador. Se cubren los problemas de la investigación básica, así como las aplicaciones y la investigación traslacional. La revista también publicará artículos que serán de amplio interés para la comunidad computacional en áreas como la educación y el desarrollo profesional.

Los artículos se publicarán en una variedad de categorías temáticas, incluidas a continuación:

Análisis del genoma
Análisis de secuencia
Filogenia
Bioinformática Estructural
Regulación génica
Genética y Análisis de Poblaciones
Biología de Sistemas
Minería de datos y texto
Bases de datos y ontologías
Informática de Bioimagen
Software
Visualización de datos
Bioinformática de Enfermedades/Medicina Traslacional
Educación y Carreras
Proteómica y Metabolómica
Neurociencias Computacionales
Cáncer
Química
Metagenómica
Inmunoinformática
Evolución
Epigenética
Biología Sintética

Idioma: inglés

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Frontiers in Bioinformatics

Revista a texto completo y arbitrada de la editorial Frontiers Media S.A., que publica investigaciones sobre herramientas y algoritmos usados en el análisis de datos biológicos.
Frontiers in Bioinformatics actualmente cubre las áreas de investigación en las secciones especializadas que publican investigaciones originales, revisiones, opiniones y comentarios. Esto comprende el completo espectrum de específicas herramientas computacionales al análisis de los datos biológicos.

Frontiers in Bioinformatics tiene el objetivo de convertirse en un forum donde nuevos hallazgos en todos los aspectos de la bioinformática pudieran ser presentados.

Frontiers in Bioinformatics est compuesta de las siguiintes secciones especializadas:
Bioimagen computacional
Visualización de datos
Descubrimiento de fármacos en bioinformática
Análisis genómico
Bioinformática Integrativa
Red bioinformática
Bioinformática de Proteínas

Las secciones de especialidad de Frontiers in Bioinformatics dan la bienvenida a la presentación de los siguientes tipos de artículos: Informe de investigación breve, Informe de caso, Corrección, Informe de datos, Editorial, Comentario general, Hipótesis y teoría, Métodos, Mini revisión, Opinión, Investigación original, Perspectiva, Revisión, Gran desafío especializado, Revisión sistemática, Tecnología y Código y resumen de políticas.  Idioma: inglés

 

 

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IEEE Open Journal of Engineering in Medicine and Biology

Revista a texto completo y arbitrada de la Sociedad IEEE de Ingeniería en Medicina y Biología que cubre el desarrollo y aplicación de los conceptos y métodos  ingemieros a la biología, medicina y ciencias de la salud para brindar soluciones efectivas a los problemas biológicos, médicos y de atención de salud.

Abarca el desarrollo de teorías matemáticas, principios físicos, biológicos y químicos, modelos y algoritmos computacionales, dispositivos y sistemas para aplicaciones clínicas, industriales y educativas. Es una revista científica en la confluencia de ciencia y tecnología. Esta elección está motivada por la observación de que el futuro de la medicina está en una combinación de biología y tecnología. Fomentar las interacciones en la intersección de estas disciplinas es clave para promover descubrimientos relevantes para mejorar la atención clínica. Esta revista es la primera en servir a la comunidad de innovadores en la intersección de estos campos.
Para facilitar el intercambio de información científica entre los miembros de esta comunidad, IEEE OJEMB ofrece dos formatos: un formato de revista científica para trabajos con un enfoque principal en informar resultados científicos y un formato IEEE más tradicional para “manuscritos tecnológicos”, que son manuscritos con un enfoque principal en el desarrollo de nuevos dispositivos, métodos y tecnologías relevantes para el campo de la ingeniería biomédica.
Formato para un “manuscrito científico”:
Introducción
Resultados
Discusión
Conclusiones
Materiales y métodos
Materiales complementarios
Formato para un “manuscrito tecnológico”:
Introducción
Materiales y métodos
Resultados
Discusión
Conclusiones
Materiales complementarios
Para ambos formatos, para aumentar el número de lectores y hacer que su trabajo sea más accesible para la comunidad clínica, incluimos una breve Declaración de importancia que resume los principales hallazgos o “mensaje para llevar a casa” de la investigación. También alentamos a los autores a incluir un resumen visual del trabajo, una imagen que resume la idea principal del artículo.
Asuntos:
Bioingeniería
Componentes, circuitos, dispositivos y sistemas
Computación y Procesamiento

Idioma. inglés