Bioinformática

Journal of Integrative Bioinformatics

Journal of Integrative Bioinformatics

Revista a texto completo y arbitrada de la editorial MBio e.V. que publica artículos de investigación en todos los aspectos de la bioinformática integrativa principalmente en:

  • bases de datos biológicas moleculares y aplicaciones;
  • integración de conjuntos de datos  biológicos moleculares, médicos y otros relacionados  relevantes para sistemas biológicos;
  • integración de aplicaciones  biológicas moleculares, médicas y otras relacionadas  relevantes para sistemas biológicos;
  • diseño de redes metabólicas reguladoras y de expresión;
  • estudios interdisciplinarios de estas redes metabólicas;
  • evaluación de datos experimentales originales con instrumentos biocomputacionles;
  • recursos en línea para científicos experimentales.

Idioma: inglés

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Vedic Research International Bioinformatics & Proteomics

Vedic Research International Bioinformatics & Proteomics

Revista científica internacional, a texto completo y arbitrada, de frecuencia trimestral (4 números al año), de la editorial Vedic Research International, publica todas las áreas de bioinformática, químicainformática,  informática médica. Se aceptan en general todas las áreas de la bioinformática y proteómica, es decir, la bioinformática, microarrays, expresión génica, NGS, proteómica, diseño de fármacos, química y médica informática.
VRI-Bioinformática y Proteómica publica artículos regulares de investigación, cartas al editor, comunicaciones cortas, mini críticas y comentarios que se ocupende todos los aspectos del uso de la biología computacional. VRI-Bioinformática y Proteómica está alentando a los científicos a publicar los datos experimentales tan elaborados como sea posible. Idioma: inglés

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MITOMAP. A human mitochondrial genome database

MITOMAP. A human mitochondrial genome database

Plataforma bioinformática que colecciona informes publicados y datos inéditos sobre la variación mitocondrial humana del ADN. La mayor parte de los datos son curados manualmente y, debido al volumen masivo de ordenar los datos que son producidos por todo el mundo, hay siempre una reserva de trabajos y de los datos que se agregarán. Forma parte del Centro para la Medicina Mitocondrial y Epigenómica de Doug Wallace en el Hospital del Niño de  Philadelphia. Idioma: inglés

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GigaScience

GigaScience

Revista a texto completo y arbitrada de la editorial Biomed Central que pretende revolucionar la difusión de datos, la organización, la comprensión y su uso. Publica estudios de “grandes-datos” de todo el espectro de la vida y las ciencias biomédicas. Para lograr nuestros objetivos, la revista tiene un formato de publicación novedoso:  publicación de manuscritos estándarizados que enlazan  con una extensa base de datos que aloja todos los datos asociados y proporciona herramientas de análisis de datos y recursos de nubes de computación .
GigaScience tiene por objeto aumentar la transparencia y reproducibilidad de la investigación, haciendo hincapié en la calidad y utilidad en la evaluación subjetiva de impacto inmediato. Para habilitar el acceso futuro y análisis, es necesario que todos los datos de apoyo y código fuente sea públicamente disponible y ofrecemos una amplia base de datos y el repositorio de nube que puede albergar datos asociados, la información complementaria y herramientas.
Una característica única de la base de datos es que los conjuntos de datos asociados importantes puede dar DOI, proporcionando tanto permanencia y una citación adicional. Así GigaScience proporciona un acceso más fácil a los datos asociados, así como el reconocimiento de los productores de datos.
GigaScience tiene como objetivo ayudar al creciente número de estudios que se basan en extremadamente grandes conjuntos de datos  maximizando su acceso en el futuro, su análisis y su reutilización.

La revista y la base de datos han sido publicadas en colaboración entre BGI Shenzhen y BioMed Central, para satisfacer las necesidades de una nueva generación de investigación biológica y biomédica ya que entra en la era de los “grandes datos”. BGI (anteriormente conocido como Instituto de Genómica de Beijing) se fundó en 1999 y desde entonces se ha convertido en la mayor organización genómica en el mundo y tiene un historial probado de la investigación innovadora, de alto perfil. Idioma: inglés

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Encode-Encyclopedia of DNA Elements

Encode-Encyclopedia of DNA Elements

El Consorcio de la  Enciclopedia de Elementos de ADN (ENCODE) es una colaboración internacional de grupos de investigación financiados por el National Human Genome Research Institute (NHGRI). El objetivo de ENCODE es construir una lista de piezas completo de elementos funcionales en el genoma humano, incluyendo elementos que actúan en los niveles de proteína y de ARN, y los elementos reguladores que las células de control y las circunstancias en las que un gen está activo. Los datos de ENCODE ya están disponibles para todo el genoma humano. Todos los datos de ENCODE están libres y disponibles para su uso inmediato a través de:

Idioma: inglés

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Microbial Informatics and Experimentation

Microbial Informatics and Experimentation

Revista a texto completo y arbitrada de la editorial BioMed Central, que publica la investigación de alta calidad relacionados con la aplicación de métodos computacionales para datos de sistemas y organismos microbianos. La revista pretende ser un recurso para los científicos computacionales y experimentales, en los cuales los métodos computacionales informan la experimentación, y viceversa.Temas de interés, reflejado en la Junta Editorial, incluyen, pero no se limitan a:

  • Genómica comparativa microbiana
  • Función y estructura de la proteína microbiana
  • Metagenómica
  • Biología de sistemas microbianos
  • Modelización matemática del sistema microbiano

Idioma: inglés

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EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology

EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology

Revista a texto completo y arbitrada de la editorial Springer que publica los resultados de la investigación relacionada con las teorías de procesamiento de señal y la bioinformática y las técnicas relevantes para una amplia área de aplicaciones en las disciplinas básicas de la nueva genómica, la proteómica y la biología de sistemas.
La revista pretende ofrecer una plataforma común para científicos de varias áreas, incluyendo el procesamiento de señales, la bioinformática, la estadística, la biología y la medicina, que están interesados ​​en el desarrollo de algoritmos, técnicas matemáticas, estadísticas, modelización, la simulación, la minería de datos y computación, según lo exigido por diversas aplicaciones de la genómica, la proteómica, biología de sistemas, y más general de la salud y la medicina.
Los artículos deben hacer hincapié en los resultados originales relacionados con los aspectos teóricos y algoritmos de procesamiento de señales y la bioinformática, en estrecha relación con las aplicaciones de la genómica, la proteómica, biología de sistemas y la medicina. Artículos tutoriales, sobre todo haciendo hincapié en los fuertes componentes de procesamiento de señales o la bioinformática en observaciones de carácter multidisciplinario de la genómica, la proteómica y la biología de sistemas también son bienvenidos. La revista abarca una amplia gama de temas, y acomodará a diferentes sistemas de exposición, para ayudar a los científicos de diversos ámbitos, por ejemplo, la ingeniería, la bioinformática o la biología, para interactuar sin esfuerzo y facilitar el intercambio de información entre las áreas multidisciplinares que participan. EURASIP cuenta con presentaciónes electrónicas y sistemas de evaluación para promover un rápido cambio en el proceso de revisión por pares. Idioma: inglés

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Health Information Science and Systems

Health Information Science and Systems

Revista internacional multidisciplinar a texto completo y arbitrada de la editorial BioMed Central que pretende integrar la informática / tecnología de la información con la ciencia de la salud y los servicios, que abarca la investigación en ciencias de la información, junto con temas relacionados con el modelado, diseño, desarrollo, integración y gestión de sistemas de información sanitaria.
Abarca todos los aspectos de la la información en ciencias de la salud  y los sistemas que soportan esta información. El alcance incluye i) médico / salud / biomedicina recursos de información, como registros médicos del paciente dispositivos y equipos, software y herramientas para capturar, almacenar, recuperar, procesar, analizar, optimizar el uso de la información en el ámbito de la salud, ii) los datos gestión, minería de datos y descubrimiento de conocimientos, todos los cuales desempeñan un papel clave en la toma de decisiones, la gestión de la salud pública, el examen de las normas, la privacidad y seguridad, iii) el desarrollo de nuevas arquitecturas y aplicaciones de sistemas de información sanitaria. La cobertura de tópicos que  incluye, pero no se limita a, los siguientes temas:

  • Sistemas de información incluyendo los registros electrónicos de salud, sistemas de información hospitalarios, el intercambio de datos e integración
  • Prestación de servicios sanitarios, el flujo de trabajo
  • La minería de datos, el descubrimiento del conocimiento, la toma de decisiones de apoyo
  • Interoperabilidad de los sistemas, la ontología y la normalización
  • Bioinformática
  • Informática biomédica
  • Cerebro informático
  • Telemedicina
  • Gestión de datos de salud
  • Base de datos e integración de información del sistema de salud
  • Extracción de información de salud
  • Servicios de información sanitaria
  • Información de salud – sistema de modelado, diseño y desarrollo
  • Visualización de información de salud
  • Herramientas de apoyo e idiomas para el desarrollo de los sistemas de información sobre la salud

Publica  artículos sobre métodos de investigación y los conocimientos conceptuales que son motivados en atención de salud , pero podría ser aplicado ampliamente en diversos ámbitos, tanto dentro como fuera del contexto de salud. Los métodos se pueden extraer de tecnologías de la información, ciencias de la computación, la bioinformática, la biomedicina, la ciencia de decisiones, la ciencia cognitiva, psicología, ciencias de la gestión, y las estadísticas.Los artículos hacen hincapié en la gestión de la información y de representación del conocimiento / modelo los problemas que surgen del almacenamiento y uso de la informática de salud también serán considerados. Las descripciones del sistema son bienvenidos si ilustran y justifican la metodología correspondiente. Idioma: inglés

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Estrategias y herramientas bioinformáticas de análisis del genoma de las enfermedades monogénicas y complejas

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Estrategias y herramientas bioinformáticas de análisis del genoma de las enfermedades monogénicas y complejas

El presente artículo es un extracto de la transcripción de la conferencia pronunciada el 26 de mayo de 2011 por Joaquín Dopazo (Director de Genómica Funcional del Centro de Investigación Príncipe Felipe) en la “IV Jornada para Unidades de Consejo Genético en cáncer hereditario”, organizada por la SEOM con la colaboración del Instituto Roche.

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