septiembre 2016 Archives

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Actualizan base de datos sobre toxicogenómica

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2016 09 30 TGDUn incremento de la tercera parte de los datos, con relación a 2015, es el resultado de la reciente actualización de The Comparative Toxicogenomics Database, especializada en las interacciones entre las sustancias químicas y los productos génicos. Sus avances son comentados en Davis AP, Grondin CJ, Johnson RJ, Sciaky D, King BL, McMorran R, et al. The Comparative Toxicogenomics Database: update 2017. Nucl. Acids Res. 2016; doi: 10.1093/nar/gkw838.

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Daños cerebrales por zika son selectivos

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2016 09 30 zikaLa infección por zika en células neurales progenitoras tiene efectos más amplios sobre la expresión de genes implicados en la replicación y reparación del ADN, entre ellos p53. Estos y otros hallazgos son descritos en Zhang F, Hammack C, Ogden SC, Cheng Y, Lee EM, Wen Z, et al. Molecular signatures associated with ZIKV exposure in human cortical neural progenitors. Nucl. Acids Res. 2016; doi: 10.1093/nar/gkw765.

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Otra revisión sobre tecnología CRISPR

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2016 09 30 CRISPRAdemás de sus potenciales aplicaciones médicas, la edición del genoma se emplea ya en las mejoras de las cosechas y del ganado, en la manipulación de insectos para controlar enfermedades y otras. El tema es abordado en Barrangou R, Doudna JA. Applications of CRISPR technologies in research and beyond. Nature Biotechnology 2016;34:933–941.

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Más controversias sobre pruebas genómicas personales

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Dos perspectivas diferentes sobre la utilización de pruebas genómicas directamente por los consumidores aparecen en:
2016 09 30 DTCLaestadius LI, Rich JR, Auer PL. All your data (effectively) belong to us: data practices among direct-to-consumer genetic testing firms. Genetics in Medicine 2016; doi:10.1038/gim.2016.136
Krieger JL, Murray F, Roberts JS, Green RC. The impact of personal genomics on risk perceptions and medical decision-making. Nature Biotechnology 2016;34:912–918

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Aclarando las zonas oscuras del genoma

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2016 09 30 noncodingPor medio de la edición de genoma en zonas no codificadoras que rodean los genes NF1, NF2 y CUL3, se encontraron áreas vinculadas con factores de transcripción, modificaciones epigenéticas y secuencias relacionadas con la resistencia a fármacos. Así se describe en Sanjana NE, Wright J, Zheng K, Shalem O, Fontanillas P, Joung J, et al. High-resolution interrogation of functional elements in the noncoding genome. Science  30 Sep 2016;353(6307):1545-1549.

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Variantes para hipertensión, autismo, mecanocepción, comportamiento, otitis media y peso al nacer

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Trans-ancestry meta-analyses identify rare and common variants associated with blood pressure and hypertension
Meta-analysis identifies common and rare variants influencing blood pressure and overlapping with metabolic trait loci
The genetics of blood pressure regulation and its target organs from association studies in 342,415 individuals
The Contribution of Mosaic Variants to Autism Spectrum Disorder
The Role of PIEZO2 in Human Mechanosensation
Mutations in Human Accelerated Regions Disrupt Cognition and Social Behavior
Genome-wide association study for acute otitis media in children identifies FNDC1 as disease contributing gene
Genome-wide associations for birth weight and correlations with adult disease

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Estado de farmacogenética en Centroamérica y el Caribe

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2016 09 30 PGxLas investigaciones sobre farmacogenética en América Central y el Caribe son escasas o nulas, limitadas a la oncología y dirigidas a los biomarcadores CYP2D6 y HLA-A/B. Tales resultados son divulgados en Céspedes-Garro C, Naranjo MG, Rodrigues-Soares F, LLerena A, Duconge J, Montané-Jaime LK, et al. Pharmacogenetic research activity in Central America and the Caribbean: a systematic review. Pharmacogenomics. 2016 Sep 16.

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Imparten curso de bioinformática en Uruguay

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2016 09 30 Wellcome CampusOrganizado por The Wellcome Trust y celebrado en el Instituto de Higiene de Montevideo, Uruguay, sesionó entre el 12 y el 16 de septiembre el curso Human and Vertebrate Genomics: Bioinformatics Tools and Resources. Con estudiantes de Argentina, Brasil, Cuba, Perú y el país sede, se abordaron las aplicaciones de herramientas como Ensembl, UCSC Genome Browser, BioMart y muchos otros.

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