Microbioma

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2020 01 17 - MRAEn el genoma de una cepa multirresistente de Escherichia coli, aislada en Cuba en un cerdo sano, se encontraron cuatro plásmidos, uno de ellos portador de un gen de resistencia a una cefalosporina de tercera generación. La referencia es Hernández-Fillor RE, Brilhante M, Espinosa I, Perreten V. Complete Circular Genome Sequence of a Multidrug-Resistant Escherichia coli Strain from Cuba Obtained with Nanopore and Illumina Hybrid Assembly. Microbiol Resour Announc. 2019;8(48):e01269-19.

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2019 07 03 MicrobiomeVarios reportes divulgan los hallazgos de la segunda etapa del Proyecto Microbioma Humano, que aplica la secuenciación metagenómica para el mejor conocimiento de los microrganismos que conviven en el cuerpo humano. Nature ha preparado una colección de artículos, Human Microbiome Project, part 2.
Otros trabajos sobre el tema:
Discovery and inhibition of an interspecies gut bacterial pathway for Levodopa metabolism.
Multiple levels of the unknown in microbiome research.
The impact of skin care products on skin chemistry and microbiome dynamics.

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2019 04 12 HGTLa transferencia horizontal de genes entre las bacterias del microbioma humano es un fenómeno común y que puede llegar hasta más de la mitad de los genes en los genomas estudiados. También se han identificado genes que se comparten menos, por lo que son más útiles en los estudios filogenéticos. Tales hallazgos son descritos en Jeong H, Arif B, Caetano-Anollés G, Kim KM, Nasir A. Horizontal gene transfer in human-associated microorganisms inferred by phylogenetic reconstruction and reconciliation. Scientific Reports, 2009;9:5953.

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2019 04 15 NASAUn estudio de gemelos, llevado a cabo por la NASA, de los cuales uno permaneció en la Tierra y otro estuvo en el espacio durante más de un año, ha arrojado cambios diversos en el genoma: acortamiento de telómeros, niveles de expresión génica, daño al ADN por inversiones cromosómicas, así como afectaciones en otros sistemas. El reporte completo, en Garrett-Bakelman FE, Darshi M, Green SJ, Gur RC, Lin L, Macias BR, et al. The NASA Twins Study: A multidimensional analysis of a year-long human spaceflight. Science, 2019;364(6436):eaau8650.

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2019 02 26 BlueprintCasi dos mil nuevas especies bacterianas han sido identificadas por secuenciación de muestras intestinales, lo que incrementa en 281 % la diversidad taxonómica de la microbiota a ese nivel. Lea más en Almeida A, Mitchell AL, Boland M, Forster SC, Gloor GB, Tarkowska A, et al. A new genomic blueprint of the human gut microbiota. Nature. 2019; doi: 10.1038/s41586-019-0965-1.

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Rev Hab C MédLas tecnologías ómicas han permitido revelar la complejidad del microbioma humano, tanto en su composición, como en sus funciones e influencias en la salud y en la enfermedad. Puede leer una revisión sobre el viroma humano, las especies más abundantes, y otros aspectos de interés en Añé Kourí AL. El viroma humano. Implicaciones en la salud y enfermedad. Rev Haban Cienc Méd 2018;17(3).

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2018 04 25 EIMCLa heterogeneidad del microbioma humano, su relación con la salud y la enfermedad y las técnicas moleculares empleadas en su caracterización, son temáticas abordadas en la revisión del Campo-Moreno R, Alarcón-Cavero T, D’Auria G, Delgado-Palacio S, Ferrer-Martínez M. Microbiota en la salud humana: técnicas de caracterización y transferencia. Enferm Infecc Microbiol Clin 2018;36:241-5.

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La composición de la microbiota intestinal parece estar más influida por factores ambientales que por la ancestría, en tanto más del 20 % de su variabilidad interindividual se relaciona con la dieta y los fármacos, entre otros factores. Lea al respecto en Rothschild D, Weissbrod O, … Segal E. Environment dominates over host genetics in shaping human gut microbiota. Nature 2018;555:210–215.

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- Qin Y, Roberts JD, Grimm SA, Lih FB, Deterding LJ, Li R, et al. An obesity-associated gut microbiome reprograms the intestinal epigenome and leads to altered colonic gene expression. Genome Biology, 2018;19:7.
– Kim HJ, Kim H, Kim JK, Myeong NR, Kim T, Park T, et al. Fragile skin microbiomes in megacities are assembled by a predominantly niche-based process. Science Advances, 2018;4(3):e1701581.
– DeWeerdt S. How baby’s first microbes could be crucial to future health. Nature, 2018;555:S18-S19.

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CamelAl menos cinco nuevas especies virales han sido encontradas por secuenciación metagenómica en muestras tomadas por exudados nasofaríngeos de 108 dromedarios en un mercado de animales en Abu Dhabi. Los camélidos estaban al mismo tiempo infectados por el coronavirus del síndrome respiratorio del Medio Oriente (MERS-CoV), de acuerdo con el reporte de Li Y, Khalafalla AI, Paden CR, Yusof MF, Eltahir YM, Al Hammadi ZM, et al. Identification of diverse viruses in upper respiratory samples in dromedary camels from United Arab Emirates. PLoS ONE 2017;12(9): e0184718.