Microbioma

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Un catálogo conformado a partir de muestras de entornos naturales y artificiales, así como de hospederos humanos y de otros animales, ha aumentado en 44 % la diversidad filogenética de las bacterias. Esos y otros hallazgos son presentados en Nayfach S, Roux S, Seshadri R, Udwary D, Varghese N, Schulz F, et al. A genomic catalog of Earth’s microbiomes. Nature Biotechnology 2020;

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DaVinciUn microbioma común conformado por proteobacterias, actinobacterias y firmicutes, además de algunas clases de hongos, fue identificado en siete cuadros realizados por Leonardo Da Vinci. Así se describe en Piñar G, Sclocchi MC, Pinzari F, Colaizzi P, Graf A, Sebastiani ML, et al. The Microbiome of Leonardo da Vinci’s Drawings: A Bio-Archive of Their History. Front. Microbiol., 20 November 2020; https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.593401.

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MicrobiomeLos resultados de un ensayo clínico revelan que la microbiota intestinal de niños nacidos por cesárea, puede ser restablecida al estado que tendrían en caso de nacimiento vaginal, cuando reciben un trasplante fecal materno, sin efectos adversos. Así se revela en Korpela K; Helve O; Kolho KL; Salonen A; Andersson S; de Vos WM, et al. Maternal Fecal Microbiota Transplantation in Cesarean-Born Infants Rapidly Restores Normal Gut Microbial Development: A Proof-of-Concept Study. Cell, 2020; DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.08.047.

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Gut_microbEl número de genomas de la microbiota intestinal humana ha ascendido a 204938, que codifican para más de 170 millones de secuencias proteicas, según dos colecciones unificadas. Más del 70 % de las especies no ha sido cultivado, y el 40 % de las proteínas carece de anotaciones funcionales, según Almeida A, Nayfach S, Boland M, Strozzi F, Beracochea M, Shi ZJ, et al. A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome. Nature Biotechnology, 2020; https://doi.org/10.1038/s41587-020-0603-3.

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MicrobMapAlgunos gérmenes pueden permanecer en los ambientes hospitalarios por más de 8 años, para infectar a los enfermos de manera oportunista, así como desarrollar multirresistencia. La caracterización genómica del microbioma de un hospital de nivel terciario es reportada en Chng KR, Li C, Bertrand D, Ng AHQ, Kwah JS, Low HM, et al. Cartography of opportunistic pathogens and antibiotic resistance genes in a tertiary hospital environment. Nature Medicine, 2020; https://doi.org/10.1038/s41591-020-0894-4.

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2020 01 17 - MRAEn el genoma de una cepa multirresistente de Escherichia coli, aislada en Cuba en un cerdo sano, se encontraron cuatro plásmidos, uno de ellos portador de un gen de resistencia a una cefalosporina de tercera generación. La referencia es Hernández-Fillor RE, Brilhante M, Espinosa I, Perreten V. Complete Circular Genome Sequence of a Multidrug-Resistant Escherichia coli Strain from Cuba Obtained with Nanopore and Illumina Hybrid Assembly. Microbiol Resour Announc. 2019;8(48):e01269-19.

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2019 07 03 MicrobiomeVarios reportes divulgan los hallazgos de la segunda etapa del Proyecto Microbioma Humano, que aplica la secuenciación metagenómica para el mejor conocimiento de los microrganismos que conviven en el cuerpo humano. Nature ha preparado una colección de artículos, Human Microbiome Project, part 2.
Otros trabajos sobre el tema:
Discovery and inhibition of an interspecies gut bacterial pathway for Levodopa metabolism.
Multiple levels of the unknown in microbiome research.
The impact of skin care products on skin chemistry and microbiome dynamics.

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2019 04 12 HGTLa transferencia horizontal de genes entre las bacterias del microbioma humano es un fenómeno común y que puede llegar hasta más de la mitad de los genes en los genomas estudiados. También se han identificado genes que se comparten menos, por lo que son más útiles en los estudios filogenéticos. Tales hallazgos son descritos en Jeong H, Arif B, Caetano-Anollés G, Kim KM, Nasir A. Horizontal gene transfer in human-associated microorganisms inferred by phylogenetic reconstruction and reconciliation. Scientific Reports, 2009;9:5953.

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2019 04 15 NASAUn estudio de gemelos, llevado a cabo por la NASA, de los cuales uno permaneció en la Tierra y otro estuvo en el espacio durante más de un año, ha arrojado cambios diversos en el genoma: acortamiento de telómeros, niveles de expresión génica, daño al ADN por inversiones cromosómicas, así como afectaciones en otros sistemas. El reporte completo, en Garrett-Bakelman FE, Darshi M, Green SJ, Gur RC, Lin L, Macias BR, et al. The NASA Twins Study: A multidimensional analysis of a year-long human spaceflight. Science, 2019;364(6436):eaau8650.