Otros Proyectos Genoma

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Tiomargarita magnifica es una bacteria que puede superar el centímetro de longitud, lo que la hace visible al ojo humano, con un genoma de más de 11000 genes que no está libre en el citoplasma. El hallazgo es reportado en Volland JM, Gonzalez-Rizzo S, Gros O, Tyml T, Ivanova N, Schulz F, et al. A centimeter-long bacterium with DNA compartmentalized in membrane-bound organelle. bioRxiv, 2022; https://doi.org/10.1101/2022.02.16.480423.

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Con el objetivo de secuenciar, catalogar y caracterizar los genomas de toda la biodiversidad eucariótica del planeta, en un periodo de diez años, ha sido lanzado el Proyecto BioGenoma de la Tierra (en inglés, Earth BioGenome Project – EBP). Un comentario al respecto puede ser consultado en Lewin HA, Robinson GE, Kress WJ, Baker WJ, Coddington J, Crandall KA, et al. Earth BioGenome Project: Sequencing life for the future of life. PNAS, 2022;119(4).

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Gut_microbEl número de genomas de la microbiota intestinal humana ha ascendido a 204938, que codifican para más de 170 millones de secuencias proteicas, según dos colecciones unificadas. Más del 70 % de las especies no ha sido cultivado, y el 40 % de las proteínas carece de anotaciones funcionales, según Almeida A, Nayfach S, Boland M, Strozzi F, Beracochea M, Shi ZJ, et al. A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome. Nature Biotechnology, 2020; https://doi.org/10.1038/s41587-020-0603-3.

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2018 12 17 wormsLos genomas de 54 especies de parásitos, tanto nemátodos como platelmintos, han sido secuenciados y comparados. Nuevas dianas terapéuticas han sido identificadas, de acuerdo con los autores en International Helminth Genomes Consortium. Comparative genomics of the major parasitic worms. Nature Genetics 2018; http://dx.doi.org/10.1038%2Fs41588-018-0262-1.

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2018 04 25 EIMCLa heterogeneidad del microbioma humano, su relación con la salud y la enfermedad y las técnicas moleculares empleadas en su caracterización, son temáticas abordadas en la revisión del Campo-Moreno R, Alarcón-Cavero T, D’Auria G, Delgado-Palacio S, Ferrer-Martínez M. Microbiota en la salud humana: técnicas de caracterización y transferencia. Enferm Infecc Microbiol Clin 2018;36:241-5.

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El diseño de un genoma mínimo de 473 genes y su síntesis química permitió la generación de una célula bacteriana con replicación autónoma. El resumen de este controversial resultado del equipo de Craig Venter está disponible en Hutchison III CA, Chuang RY, Noskov VN, Assad-Garcia N, Deerinck TJ, Ellisman MH, et al. Design and synthesis of a minimal bacterial genome. Science  25 Mar 2016;351(6280).

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Las muestras de 78 enfermos infectados en la actual epidemia de ébola permitieron aislar 99 secuencias virales y reconstruir la historia del brote: derivada de una cepa de África central de 2004, cruzó de Guinea a Sierra Leona en mayo de 2014 con una sostenida transmisión entre humanos sin evidencia de otras fuentes zoonóticas adicionales. Las implicaciones de las mutaciones para el diagnóstico, las vacunas y los tratamientos son comentados en Gire SK, Goba A, Andersen, Sealfon RSG, Park DJ, Kanneh L, Jalloh S, et al. Genomic surveillance elucidates Ebola virus origin and transmission during the 2014 outbreak. Science 12 September 2014;345(6202):1369-1372.

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La secuenciación del genoma de 274 cepas del Vibrio cholerae reveló que los genes de fagos, profagos, trasposones y plásmidos son los de más rápida evolución en los genomas bacterianos. Tales son los resultados expuestos en Dutilh BE, Thompson CC, Vicente ACP, Marin MA, Lee C, Silva GGZ, et al. Comparative genomics of 274 Vibrio cholerae genomes reveals mobile functions structuring three niche dimensions. BMC Genomics 2014;15:654.