Biología de sistemas

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2017 07 22 mouse modelsEl Consorcio Internacional de Fenotipificación Murina (en inglés the International Mouse Phenotyping Consortium) ha propuesto modelos para los síndromes Bernard–Soulier tipo C, Bardet–Biedl-5 y Gordon Holmes. El texto completo aparece en Meehan TF, Conte N, West DB, Jacobsen JO, Mason J, Warren J, et al. Disease model discovery from 3,328 gene knockouts by The International Mouse Phenotyping Consortium. Nature Genetics 2017; doi:10.1038/ng.3901.

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17La agencia aeroespacial de Estados Unidos (NASA por sus siglas en inglés) ha anunciado que la tripulación de la Estación Espacial Internacional ha realizado sus primeros experimentos de secuenciación, aunque las muestras fueron preparadas en tierra para evitar los problemas que genera la ingravidez. Así se divulga en una nota de la NASA.

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2016 04 09 Down 1El análisis transcriptómico ha revelado un defecto en la mielinización y diferenciación de los oligodendrocitos en los pacientes con síndrome de Down. Los detalles de los estudios en humanos y animales son descritos en Olmos-Serrano JL, Jung Kang H, Tyler WA, Silbereis JC, Cheng F, Zhu Y, et al. Down Syndrome Developmental Brain Transcriptome Reveals Defective Oligodendrocyte Differentiation and Myelination. Neuron 2016;89(6):1208–1222.

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psoriasisEl análisis de conjunto de datos de microarrays en la psoriasis ha revelado una vía de señalización JAK/STAT y varios candidatos a biomarcadores y terapias para la enfermedad. El texto completo del trabajo puede ser consultado en Sevimoglu T, Arga KY. Computational Systems Biology of Psoriasis: Are We Ready for the Age of Omics and Systems Biomarkers? OMICS: A Journal of Integrative Biology. November 2015;19(11):669-687.

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Las técnicas de análisis de las redes de genes y vías de señalización implicadas en la génesis y progresión de los tumores malignos son comentadas en Creixell P, Reimand J, Haider S, Wu G, Shibata T, Vazquez M, et al. Pathway and network analysis of cancer genomes. Nature Methods 2015;12:615–621.

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Por medio de la espectrometría de masa se ha revelado una red de 23744 interacciones entre 7668 proteínas en una línea celular, la mayoría de ellas no documentadas hasta ahora. Algunas aplicaciones médicas de este resultado son comentadas en Huttlin EL, Ting L, Bruckner RJ, Gebreab F, Gygi MP, Szpyt J, et al. The BioPlex Network: A Systematic Exploration of the Human Interactome. Cell 16 July 2015;162(2):425–440.

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La identificación, por métodos bioinformáticos, de los factores de transcripción que regulan la expresión de los interferones de tipo I, podría conducir a nuevas terapias para las infecciones virales y las enfermedades autoinmunes. Así se concluye en Feng D, Barnes BJ. Bioinformatics analysis of the factors controlling type I IFN gene expression in autoimmune disease and virus-induced immunity. Front. Immunol. 2013;4:291. doi: 10.3389/fimmu.2013.00291.

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El empleo de las tecnologías genómicas para el estudio de la metilación parcial de dominios en la placenta humana a término ha revelado la existencia de genes con funciones tisulares específicas. Algunas implicaciones para el desarrollo fetal y la tumorigénesis son discutidas en Schroeder DI, Blaird JD, Lott P, Yu HOK, Hong D, Crary F et al. The human placenta methylome. PNAS March 25, 2013 , doi: 10.1073/pnas.1215145110.