Llevar las intervenciones sanitarias hacia donde más se necesiten, con el uso de las tecnologías ómicas y el análisis de datos para hacer una salud púbica de precisión, es un tema de debate presentado en Arnold C. Is precision public health the future — or a contradiction? Nature 2022;601:18-20.
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Las implicaciones éticas de la aplicación de los estudios genómicos durante la pandemia de covid-19 son abordadas en una revisión narrativa, que puede consultar en Quintana-Hernández D, Rojas-Betancourt I, Quintana-Mora D, Fajardo-Peña Y, Oviedo-de-la-Cruz L. Genética, Genómica y COVID-19: implicaciones éticas. Medimay, 2021;28(4).
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– Genome-wide association studies identify the role of caspase-9 in kidney disease
– Genome-wide association study identifies susceptibility loci for acute myeloid leukemia
– Identification of genetic variations associated with drug resistance in non-small cell lung cancer patients undergoing systemic treatment
– Genome-wide analysis of common and rare variants via multiple knockoffs at biobank scale, with an application to Alzheimer disease genetics
– Genome-wide association study reveals genetic variants associated with HIV-1C infection in a Botswana study population
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Tres metanálisis de estudios de asociación de genoma completo, que consideraron 49562 pacientes de 19 países, encontraron 13 loci relacionados con la infección y formas graves de la covid-19. Otros elementos son presentados en COVID-19 Host Genetics Initiative. Mapping the human genetic architecture of COVID-19. Nature. 2021; https://doi.org/10.1038/s41586-021-03767-x.
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El haloperidol y la clofazimina están entre los 11 medicamentos con actividad antiviral frente a SARS-CoV-2, a partir de las diferencias en los patrones de expresión génica entre muestras de infectados y controles. El reporte aparece en Le BL, Andreoletti G, Oskotsky T, Vallejo-Gracia A, Rosales R, Yu K, et al. Transcriptomics-based drug repositioning pipeline identifies therapeutic candidates for COVID-19. Scientific Reports 2021;11:12310.
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Muestras pulmonares obtenidas por cirugía de pacientes tuberculosos tuvieron un 40 % de infecciones por al menos dos cepas no relacionadas, a partir de la secuenciación genómica, lo que puede pasar inadvertido en muestras de esputo. Las implicaciones clínicas son discutidas en Moreno-Molina M, Shubladze N, Khurtsilava I, Avaliani Z, Bablishvili N, Torres-Puente M, et al. Genomic analyses of Mycobacterium tuberculosis from human lung resections reveal a high frequency of polyclonal infections. Nature Communications. 2021;12:2716.
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La herramienta GISAID ha recibido 1,2 millones de secuencias de genoma del SARS-CoV-2, provenientes de 178 países. Ello ha sido crucial para estudiar los brotes y la aparición de variantes, un ejemplo de la nueva “epidemiología genómica”. Un comentario al respecto aparece en Maxmen A. One million coronavirus sequences: popular genome site hits mega milestone. Nature, 2021; doi: https://doi.org/10.1038/d41586-021-01069-w.
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Las poblaciones naturales de E. coli y otras enterobacterias contienen plásmidos con genes de resistencia a antibióticos, los cuales están bajo fuerte presión selectiva. Ello es muestra de las complejas dinámicas microbianas y su impacto en la salud humana, de acuerdo con Shaw LP, Chau KK, Kavanagh J, AbuOun M, Stubberfield E, Gweon HS, et al. Niche and local geography shape the pangenome of wastewater- and livestock-associated Enterobacteriaceae. Science Advances 2021;7(15):eabe3868.
– The Human Genome Organisation (HUGO) and the 2020 COVID-19 pandemic
– Policy for Evaluating Impact of Viral Mutations on COVID-19 Tests Guidance for Test Developers and Food and Drug Administration Staff February 2021
– Genomic sequencing in pandemics
– Insights from SARS-CoV-2 sequences
– SARS-CoV-2 within-host diversity and transmission
– Alarming COVID variants show vital role of genomic surveillance
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Genome Editing and the Future of Personalized and Targeted Cancer Medicine
Colección de Molecular Cancer
Open Access
