Patógenos

Pangolín hospeda coronavirus similares a SARS CoV-2

0

SARSCoV-2La secuenciación y análisis filogenéticos de coronavirus aislados de pangolines capturados en el sur de China, han revelado una estrecha similitud con el SARS CoV-2. Ello coloca al pangolín (Manis javanica) como un posible eslabón en la cadena que llevó a la actual pandemia. El reporte, aún como manuscrito no editado, puede descargarse en Lam TT, Shum MH, Zhu H, Tong YG, Ni XB, Liao YS, et al. Identifying SARS-CoV-2 related coronaviruses in Malayan pangolins. Nature 2020; https://doi.org/10.1038/s41586-020-2169-0.

Filed under Bioinformática, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Genoma de SARS-CoV-2: no fue hecho en laboratorio

0

SARSCoV2.jpgLas características distintivas del genoma del coronavirus SARS-CoV-2 revelan que no es una construcción de laboratorio ni fue manipulado intencionalmente. Tampoco queda claro cuál puede haber sido el hospedero que dio origen a este patógeno emergente, de acuerdo con la opinión de Andersen KG, Rambaut A, Lipkin WI, Holmes EC, Garry RF. The proximal origin of SARS-CoV-2. Nature Medicine 2020; https://doi.org/10.1038/s41591-020-0820-9

Filed under Diagnóstico, Filogenética, Genómica, Patógenos by on . Comment. #

Identifican marcador de letalidad para ébola

0

2020 02 11 EbolaLa inhibición de una precoz expresión génica y la señalización inflamatoria descontrolada, entre otras, son características que se relacionan con un riesgo mayor de muerte por ébola, revelados por perfiles transcriptómicos en ratones. Tal es el reporte en Price A, Okumura A, Haddock E, Feldmann F, Meade-White K, Sharma P, et al. Transcriptional Correlates of Tolerance and Lethality in Mice Predict Ebola Virus Disease Patient Outcomes. Cell Reports 2020;30(6):1702-1713.e6.

Filed under Patógenos, Polimorfismos, Transcriptómica by on . Comment. #

Otras características del coronavirus 2019-nCoV

0

2020 02 11 - CoronavirusEl estudio del genoma del nuevo coronavirus ha encontrado que se distingue del virus que causó el SARS, en más de 380 aminoácidos, lo que podría explicar en parte las diferencias patogénicas entre ambos agentes. Otros interesantes hallazgos están en Wu A, Peng Y, Huang B, Ding X, Wang X, Niu P, et al. Genome Composition and Divergence of the Novel Coronavirus (2019-nCoV). Originating in China. Cell Host & Microbe 2020; DOI:https://doi.org/10.1016/j.chom.2020.02.001

Filed under Diagnóstico, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Analizan genoma de coronavirus de Wuhan

0

2020 02 02 2019 nCoVLa secuenciación y análisis del genoma del coronavirus responsable del brote iniciado en Wuhan, China, han revelado que es un nuevo miembro del género Betacoronavirus, pudo provenir de murciélagos y podría unirse al receptor 2 de la enzima convertidora de angiotensina. Esos y otros detalles aparecen en Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H, et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet 2020; DOI:https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8.

Filed under Bioinformática, Diagnóstico, Filogenética, Genómica, Patógenos by on . Comment. #

Secuencian genoma de E. coli aislada en Cuba

0

2020 01 17 - MRAEn el genoma de una cepa multirresistente de Escherichia coli, aislada en Cuba en un cerdo sano, se encontraron cuatro plásmidos, uno de ellos portador de un gen de resistencia a una cefalosporina de tercera generación. La referencia es Hernández-Fillor RE, Brilhante M, Espinosa I, Perreten V. Complete Circular Genome Sequence of a Multidrug-Resistant Escherichia coli Strain from Cuba Obtained with Nanopore and Illumina Hybrid Assembly. Microbiol Resour Announc. 2019;8(48):e01269-19.

Filed under Diagnóstico, Microbioma, Patógenos by on . Comment. #

Posibles riesgos de edición anti-vih del genoma

0

2019 07 03 CRISPRUn comentario en la revista Nature alerta sobre la posible reducción de la esperanza de vida en individuos a quienes se manipule el genoma para expresar las variantes mutadas de CCR5, que confieren resistencia a la infección por vih. Lea en Reardon S. Gene edits to ‘CRISPR babies’ might have shortened their life expectancy. Nature 2019;570:16-17.

Filed under Edición del genoma, Medicina personalizada, Patógenos, Tratamientos by on . Comment. #

Reportan resultados de Proyecto Microbioma Humano

0

2019 07 03 MicrobiomeVarios reportes divulgan los hallazgos de la segunda etapa del Proyecto Microbioma Humano, que aplica la secuenciación metagenómica para el mejor conocimiento de los microrganismos que conviven en el cuerpo humano. Nature ha preparado una colección de artículos, Human Microbiome Project, part 2.
Otros trabajos sobre el tema:
– Discovery and inhibition of an interspecies gut bacterial pathway for Levodopa metabolism.
– Multiple levels of the unknown in microbiome research.
– The impact of skin care products on skin chemistry and microbiome dynamics.

Filed under Medicina personalizada, Microbioma, Patógenos, Tratamientos by on . Comment. #

Secuencian la más antigua cepa de cólera

0

2019 04 15 cholera1916La más antigua cepa de Vibrio cholerae, obtenida de un soldado británico en 1916, durante la Primera Guerra Mundial, ha sido secuenciada. Se ha encontrado que no producía toxina colérica y contenía el gen de resistencia a la penicilina, décadas antes de que el antibiótico se obtuviera. El reporte original aparece en Dorman MJ, Kane L, Domman D, Turnbull JD, Cormie C, Fazal MA, et al. The history, genome and biology of NCTC 30: a non-pandemic Vibrio cholerae isolate from World War One. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2019;286(1900):20182025.

Filed under Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Comparan genomas de decenas de parásitos

0

2018 12 17 wormsLos genomas de 54 especies de parásitos, tanto nemátodos como platelmintos, han sido secuenciados y comparados. Nuevas dianas terapéuticas han sido identificadas, de acuerdo con los autores en International Helminth Genomes Consortium. Comparative genomics of the major parasitic worms. Nature Genetics 2018; http://dx.doi.org/10.1038%2Fs41588-018-0262-1.

Filed under Filogenética, Genómica, Otros Proyectos Genoma, Patógenos, Tratamientos by on . Comment. #

1 2 3 4 5 6 7