Patógenos

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Lieberman TDLas peculiaridades de la migración del Mycobacterium tuberculosis entre órganos de individuos con vih son divulgadas en Lieberman TD, Wilson D, Misra R, Xiong LL, Moodley P, Cohen T, et al. Genomic diversity in autopsy samples reveals within-host dissemination of HIV-associated Mycobacterium tuberculosis. Nature Medicine 2016; doi:10.1038/nm.4205. Mientras, la distribución global de una cepa de la bacteria es dilucidada en Stucki D, Brites D, Jeljeli L, Coscolla M, Liu Q, Trauner A, et al. Mycobacterium tuberculosis lineage 4 comprises globally distributed and geographically restricted sublineages. Nature Genetics 2016; doi:10.1038/ng.3704.

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A partir de muestras colectadas en más de 700 hogares en todo Estados Unidos, se ha abordado por medio de la secuenciación la diversidad y los potenciales riesgos para la salud humana de los artrópodos que habitan en las casas. Así se presenta en Madden AA, Barberán A, Bertone MA, Menninger HL, Dunn RR, Fierer N, et al. The diversity of arthropods in homes across the United States as determined by environmental DNA analyses. Molecular Ecology2016;25(21).

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E. SienaLas evidencias sobre la diversidad fenotípica y los mecanismos genéticos subyacentes en la bacteria Neisseria meningitidis han sido reforzadas a partir de la secuenciación y comparación genómicas de colonias obtenidas en condiciones poco selectivas. Los hallazgos aparecen en Siena E, D’Aurizio R, Riley D, Tettelin H, Guidotti S, Torricelli G, et al. In-silico prediction and deep-DNA sequencing validation indicate phase variation in 115 Neisseria meningitidis genes. BMC Genomics 2016;17:843.

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E. C. HolmesEl análisis de las secuencias genómicas de muestras de virus Ébola arroja luz sobre los orígenes, la evolución y la diseminación del agente durante el brote 2013-2016 en África. Lea los detalles en Holmes EC, Dudas G, Rambaut A, Andersen KG. The evolution of Ebola virus: Insights from the 2013–2016 epidemic. Nature 2016;538:193–200.

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2016 09 30 zikaLa infección por zika en células neurales progenitoras tiene efectos más amplios sobre la expresión de genes implicados en la replicación y reparación del ADN, entre ellos p53. Estos y otros hallazgos son descritos en Zhang F, Hammack C, Ogden SC, Cheng Y, Lee EM, Wen Z, et al. Molecular signatures associated with ZIKV exposure in human cortical neural progenitors. Nucl. Acids Res. 2016; doi: 10.1093/nar/gkw765.

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4El viroma o población viral del planeta es más amplio, diverso y complejo de lo que se pensaba. Un abarcador estudio en busca de secuencias virales ha duplicado el número de especies microbianas infectadas por estos agentes y ha identificado el más grande fago hasta ahora. Otros hallazgos son comentados en Paez-Espino D, Eloe-Fadrosh EA, Pavlopoulos GA, Thomas AD, Huntemann M, Mikhailova N, et al. Uncovering Earth’s virome. Nature 25 August 2016;536(425–430).

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16Una variante de Salmonella enteritidis relacionada con gastroenteritis y otras dos, ubicadas sobre todo en África, responsables de infección resistente a múltiples drogas y con capacidad de diseminación sanguínea, han sido identificadas por secuenciación del genoma completo de cientos de muestras. Lea al respecto en Feasey NA, Hadfield J, Keddy KH, Dallman TJ, Jacobs J, Deng X, et al. Distinct Salmonella Enteritidis lineages associated with enterocolitis in high-income settings and invasive disease in low-income settings. Nature Genetics 2016; doi:10.1038/ng.3644.

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5La emergencia y diseminación de una cepa de estafilococo dorado resistente a meticilina, así como su asociación a las prácticas de uso de antibióticos, son resultados del análisis de secuencias genómicas de muestras de cuatro continentes, tal como aparece en Ward MJ, Goncheva M, Richardson E, McAdam PR, Raftis E, Kearns A, et al. Identification of source and sink populations for the emergence and global spread of the East-Asia clone of community-associated MRSA. Genome Biology 2016;17:160.

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2016 08 15 zikaLa identificación de secuencias características de la familia Flaviviridae y de al menos un compuesto con capacidad de inhibir la actividad de la polimerasa viral son hallazgos divulgados en Fleming AM, Ding Y, Alenko A, Burrows CJ. Zika Virus Genomic RNA Possesses Conserved G-Quadruplexes Characteristic of the Flaviviridae Family. ACS Infect. Dis. 2016, DOI: 10.1021/acsinfecdis.6b00109.

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160723 InfluenzaLa selección e inclusión de epítopes conservados e inmunogénicos del virus A de la influenza en una vacuna puede ser un camino para la protección universal frente a la infección. Así se propone en Sheikh QM, Gatherer D, Reche PA, Flower DR. Towards the Knowledge-based Design of Universal Influenza Epitope Ensemble Vaccines. Bioinformatics 2016; doi: 10.1093/bioinformatics/btw399.