Transcriptómica

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Graphical_Abstract_Banchereau_et_alEl análisis transcriptómico de 158 pacientes con lupus ha aportado nuevos elementos moleculares sobre la expresión clínica de la enfermedad y sus marcadores de progreso. Tales avances aparecen en Banchereau R, Hong S, Cantarel B, Baldwin N, Baisch J, Edens M, et al. Personalized Immunomonitoring Uncovers Molecular Networks that Stratify Lupus Patients. Cell 2016;165(3):551–565.

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2016 04 09 Down 1El análisis transcriptómico ha revelado un defecto en la mielinización y diferenciación de los oligodendrocitos en los pacientes con síndrome de Down. Los detalles de los estudios en humanos y animales son descritos en Olmos-Serrano JL, Jung Kang H, Tyler WA, Silbereis JC, Cheng F, Zhu Y, et al. Down Syndrome Developmental Brain Transcriptome Reveals Defective Oligodendrocyte Differentiation and Myelination. Neuron 2016;89(6):1208–1222.

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endometriumLa combinación de técnicas transcriptómicas e inmunohistoquímicas en muestras de tejido endometrial permitió encontrar cuatro genes con muy altos niveles de expresión, en comparación con otros tejidos. Lea al respecto en Zieba A, Sjöstedt E, Olovsson M, Fagerberg L, Hallström BM, Oskarsson L, et al. The Human Endometrium-Specific Proteome Defined by Transcriptomics and Antibody-Based Profiling. OMICS: A Journal of Integrative Biology. November 2015;19(11):659-668.

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AsthmaTécnicas de secuenciación metagenómica de ARN han identificado poblaciones bacterianas más abundantes en la cavidad nasal de niños asmáticos, en relación con controles sanos. Moraxella catarrhalis es la más representada, de acuerdo con Castro-Nallar E, Shen Y, Freishtat RJ, Pérez-Losada M, Manimaran S, Liu G, et al. Integrating microbial and host transcriptomics to characterize asthma-associated microbial communities. BMC Medical Genomics 2015;8:50.

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ncmRNALa evaluación de las metodologías existentes para la cuantificación de ARN pequeños no codificadores (en inglés small non-coding RNAs) y su distribución en varios tejidos aparecen descritas en Lopez JP, Diallo A, Cruceanu C, Fiori LM, Laboissiere S, Guillet I, et al. Biomarker discovery: quantification of microRNAs and other small non-coding RNAs using next generation sequencing. BMC Medical Genomics 2015;8:35.

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Los avances del estudio no invasivo del genoma fetal, a partir de la sangre materna, se ha extendido a la obtención del metiloma y la secuenciación del transcriptoma, con nuevas aplicaciones para la medicina prenatal. El tema se discute en Wong AIC, Lo YMD. Noninvasive fetal genomic, methylomic, and transcriptomic analyses using maternal plasma and clinical implications. Trends in Molecular Medicine February 2015;21(2):98–108.

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La combinación de varias técnicas, incluido el análisis de microarreglos (microarrays, en inglés), ha permitido construir el primer mapa basado en la actividad transcripcional del cerebro humano en la etapa prenatal. Sobre los resultados y aplicaciones consulte Miller JA, Ding SL, Sunkin SM, Smith KA, Ng L, Szafer A, et al. Transcriptional landscape of the prenatal human brain. Nature 10 April 2014;508:199–206.