Inmunoinformática

Algoritmo para diseñar anticuerpos y otras proteínas

0

2017 10 22 AbUn algoritmo bioinformático que permite diseñar fragmentos variables funcionales y estables de anticuerpos, con afinidades nanomolares para sus ligandos, podría aplicarse al diseño de otras estructuras, como enzimas, de acuerdo con la opinión de los autores del estudio Baran D, Pszolla MG, Lapidoth GD, Norn C, Dym O, Unger T, et al. Principles for computational design of binding antibodies. PNAS 2017;114(41):10900–10905.

Filed under Algoritmos, Bioinformática, Inmunoinformática, Tratamientos by on . Comment. #

Selección de pacientes para nueva terapia oncológica

0

2016 08 15 immunooncologyLas tecnologías ómicas son cruciales para seleccionar los pacientes oncológicos que pueden beneficiarse de los inhibidores que bloquean las vías inmunitarias relacionadas con CTLA-4 y PD-1. El tema es revisado en Dijkstra KK, Voabil P, Schumacher TN, Voest EE.  Genomics- and Transcriptomics-Based Patient Selection for Cancer Treatment With Immune Checkpoint Inhibitors. JAMA Oncol. 2016; doi:10.1001/jamaoncol.2016.2214.

Filed under Farmacogenómica, Genómica, Inmunoinformática, Medicina personalizada, Polimorfismos, Transcriptómica, Tratamientos by on . Comment. #

Herramientas computacionales para oncoinmunología

0

2016 08 15 oncoimmunologyLas herramientas computacionales desarrolladas para el análisis genómico de las interacciones entre el sistema inmunitario y las células tumorales son revisadas en Hackl H, Charoentong P, Finotello F, Trajanoski Z. Computational genomics tools for dissecting tumour–immune cell interactions. Nature Reviews Genetics 2016;17:441–458.

Filed under Bioinformática, Genómica, Inmunoinformática by on . Comment. #

Aporte bioinformático en vacuna universal anti-influenza

0

160723 InfluenzaLa selección e inclusión de epítopes conservados e inmunogénicos del virus A de la influenza en una vacuna puede ser un camino para la protección universal frente a la infección. Así se propone en Sheikh QM, Gatherer D, Reche PA, Flower DR. Towards the Knowledge-based Design of Universal Influenza Epitope Ensemble Vaccines. Bioinformatics 2016; doi: 10.1093/bioinformatics/btw399.

Filed under Bioinformática, Inmunoinformática, Patógenos by on . Comment. #

Buscan vacuna contra la brucelosis

0

BrucellaLa modelación computacional de la respuesta inmune frente a proteínas seleccionadas a partir del proteoma de la bacteria Brucella melitensis condujo a la identificación de péptidos potencialmente útiles para una vacuna contra la brucelosis. El reporte aparece en Vishnu Udayakumar S, Sankarasubramanian J, Gunasekaran P, Rajendhran J. Novel Vaccine Candidates against Brucella melitensis Identified through Reverse Vaccinology Approach. OMICS: A Journal of Integrative Biology November 2015;19(11):722-729.

Filed under Inmunoinformática, Patógenos by on . Comment. #

Nuevas bases de datos sobre virus

0

flukbEPIPOX se relaciona con los ortopoxvirus, y es descrita en Molero-Abraham M, Glutting JP, Flower DR, Lafuente EM, Reche PA. EPIPOX: Immunoinformatic Characterization of the Shared T-Cell Epitome between Variola Virus and Related Pathogenic Orthopoxviruses. J Immunol Res. 2015;2015:738020. FluKB se enfoca en la influenza, y es reportada en Simon C, Kudahl UJ, Sun J, Olsen LR, Zhang GL, Reinherz EL, et al. FluKB: A Knowledge-Based System for Influenza Vaccine Target Discovery and Analysis of the Immunological Properties of Influenza Viruses. Journal of Immunology Research 2015;2015:380975.

Filed under Bases de datos, Bioinformática, Inmunoinformática, Patógenos by on . Comment. #

Mutaciones en HLA inducidas por cáncer

0

HLACerca de 300 mutaciones no silentes en puntos específicos de los genes de las moléculas HLA-A, -B y -C han sido reveladas por una metodología computacional presentada en Shukla SA, Rooney MS, Rajasagi M, Tiao G, Dixon PM, Lawrence MS, et al. Comprehensive analysis of cancer-associated somatic mutations in class I HLA genes. Nature Biotechnology 15 September 2015; doi:10.1038/nbt.3344.

Filed under Algoritmos, Bioinformática, Cáncer, Diagnóstico, Inmunoinformática by on . Comment. #

Análisis computacional podría mejorar vacunas

0

System immunology1La medición de las variaciones poblacionales y su influencia en la respuesta a la vacunación, por medio de mediciones de alto flujo y análisis computacionales podría reportar avances para la inmunización en humanos. Así se propone en Tsangemail JS. Utilizing population variation, vaccination, and systems biology to study human immunology. Trends in Immunology August 2015;36(8):479–493.

Filed under Inmunoinformática, Patógenos, Polimorfismos by on . Comment. #

Estudian evolución de virus Lassa

0

LassaLa construcción de un catálogo con secuencias de virus Lassa ha esclarecido que el contagio es fundamentalmente zoonótico y que las mutaciones afectan a epítopes de las proteínas de superficie. Puede encontrar el resumen del trabajo en Andersen KG, Shapiro BG, Matranga CB, Sealfon R, Lin AE, Moses LM, et al. Clinical Sequencing Uncovers Origins and Evolution of Lassa Virus. Cell August 2015;162(4):738–750.

Filed under Bases de datos, Filogenética, Inmunoinformática, Patógenos by on . Comment. #

En busca de una vacuna contra T. cruzi

0

El análisis del proteoma de Trypanosoma cruzi, agente causal de la enfermedad de Chagas, permitió seleccionar un grupo de secuencias que son candidatas en el diseño de una vacuna contra el protozoario. El procedimiento es descrito en Teh-Poot C, Tzec-Arjona E, Martinez-Vega P, Ramirez-Sierra MJ, Rosado-Vallado M, Dumonteil E. From genome to a vaccine against Trypanosoma cruzi by immunoinformatics. J Infect Dis. 2014 Jul 28; doi: 10.1093/infdis/jiu418.

Filed under Bioinformática, Inmunoinformática by on . Comment. #

1 2 3 4 5