Proteómica

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La integración de las técnicas genómicas y proteómicas, que incluye la generación de bases de datos, incrementa las posibilidades de identificación de proteínas y la definición de modelos de interacción entre genes. El tema puede ser revisado en Nesvizhskii AI. Proteogenomics: concepts, applications and computational strategies. Nature Methods 2014;11:1114–1125.

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Las potencialidades de la combinación de las técnicas genómicas con la espectrometría de masa para identificar péptidos mutados altamente específicos para diferentes tipos de cáncer, puede conducir a su empleo como marcadores tumorales útiles en el diagnóstico y el seguimiento de la enfermedad. Así se discurre en Diamandis EP. Towards identification of true cancer biomarkers. BMC Medicine 2014;12:156.

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El empleo de técnicas proteómicas ha llevado a cuestionar si muchas secuencias génicas son realmente codificadoras y, por la misma razón, a estimar que el genoma humano contiene un número menor de genes, calculado ahora en alrededor de 19000. Así se presenta en Ezkurdia I, Juan D, Rodriguez JM, Frankish A, Diekhans M, Harrow J, et al. Multiple evidence strands suggest that there may be as few as 19 000 human protein-coding genes. Hum Mol Genet. 2014 Jun 16; doi: 10.1093/hmg/ddu309.

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Los dos estudios recientemente publicados sobre la caracterización del proteoma humano deben ser tomados con cautela, pues se han encontrado inconsistencias a partir del análisis de la familia de los receptores olfatorios. Tal es la opinión central de Ezkurdia I, Vázquez J, Valencia A, Tress M. Analyzing the First Drafts of the Human Proteome. J Proteome Res 2014;13(8):3854–3855.

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Dos artículos recién publicados emplean la espectrometría de masa para identificar y catalogar la composición proteica de diversas muestras de tejidos y líquidos corporales. Se trata de un avance notable, no solo por el número de moléculas descritas sino por las implicaciones para la investigación biomédica. Los reportes originales son Kim MS, Pinto SM, Getnet D, Nirujogi RS, Manda SS, Chaerkady R, et al. A draft map of the human proteome. Nature 29 May 2014;509:575–581 y Wilhelm  M, Schlegl J, Hahne H, Gholami AM, Lieberenz M, Savitski MM, et al. Mass-spectrometry-based draft of the human proteome. Nature 29 May 2014;509:582–587.