La revista Nucleic Acids Research, como cada año, publicó desde enero su número especial Database, que actualiza sobre las nuevas o mejoradas bases de datos de información biológica. El editorial es Rigden DJ, Fernández-Suárez XM, Galperin MY. The 2016 database issue of Nucleic Acids Research and an updated molecular biology database collection. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D1-6.
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La secuenciación del genoma completo de una cepa de enterococo resistente a vancomicina permitió seguir su trasmisión en un hospital británico. La importancia epidemiológica de esta aplicación puede apreciarse en Brodrick HJ, Raven KR, Harrison EM, Blane B, Reuter S, Török ME, et al. Whole-genome sequencing reveals transmission of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in a healthcare network. Genome Medicine 2016;8:4.
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Web-based Gene Pathogenicity Analysis (WGPA) es una herramienta para determinar cuánto pueden aportar al riesgo de enfermar las mutaciones encontradas en los genomas individuales. Sus características y aplicaciones son descritas en Diaz-Montana JJ, Rackham OJ, Diaz-Diaz N, Petretto E. Web-based Gene Pathogenicity Analysis (WGPA): a web platform to interpret gene pathogenicity from personal genome data. Bioinformatics. 2016 Feb 15;32(4):635-7.
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Cerca de la mitad de las proteínas de eucariotas y virus contienen regiones de las que no se ha dilucidado ni modelado su estructura por homología. Ese “proteoma oscuro” es estudiado en Perdigão N, Heinrich J, Stolte C, Sabir KS, Buckley MJ, Tabor B, et al. Unexpected features of the dark proteome. PNAS 2015;112(52):15898–15903.
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Un comité del Colegio de Patólogos Americanos ha sugerido un marco para el desarrollo de bases de datos genómicos de orientación clínica. Sus consideraciones aparecen en Yohe SL, Carter AB, Pfeifer JD, Crawford JM, Cushman-Vokoun A, Caughron S, et al. Standards for Clinical Grade Genomic Databases. Archives of Pathology & Laboratory Medicine November 2015;139(11):1400-1412.
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ProteinPaint es una aplicación para visualizar las lesiones genéticas en los tumores malignos de la edad pediátrica. Es presentado en Zhou X, Edmonson MN, Wilkinson MR, Patel A, Wu G, Liu Y, et al. Exploring genomic alteration in pediatric cancer using ProteinPaint. Nature Genetics 2015;48:4-6.
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El análisis bioinformático de bases de datos metagenómicas ha revelado la existencia de un nuevo grupo de virus con similitudes a los polintovirus y los virófagos. El reporte es Yutin N, Shevchenko S, Kapitonov V, Krupovic M, Koonin EV. A novel group of diverse Polinton-like viruses discovered by metagenome analysis. BMC Biology 2015;13:95.
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El análisis de conjunto de datos de microarrays en la psoriasis ha revelado una vía de señalización JAK/STAT y varios candidatos a biomarcadores y terapias para la enfermedad. El texto completo del trabajo puede ser consultado en Sevimoglu T, Arga KY. Computational Systems Biology of Psoriasis: Are We Ready for the Age of Omics and Systems Biomarkers? OMICS: A Journal of Integrative Biology. November 2015;19(11):669-687.
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EPIPOX se relaciona con los ortopoxvirus, y es descrita en Molero-Abraham M, Glutting JP, Flower DR, Lafuente EM, Reche PA. EPIPOX: Immunoinformatic Characterization of the Shared T-Cell Epitome between Variola Virus and Related Pathogenic Orthopoxviruses. J Immunol Res. 2015;2015:738020. FluKB se enfoca en la influenza, y es reportada en Simon C, Kudahl UJ, Sun J, Olsen LR, Zhang GL, Reinherz EL, et al. FluKB: A Knowledge-Based System for Influenza Vaccine Target Discovery and Analysis of the Immunological Properties of Influenza Viruses. Journal of Immunology Research 2015;2015:380975.
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La edición 40a. del Concurso Premio Anual de la Salud de Cuba otorgó un Gran Premio a un trabajo que estudió la secuencia completa del genoma de una cepa del virus dengue 2 introducida en el país y responsable de la más grave epidemia de dengue hemorrágico. El reporte original había sido publicado en Rodriguez-Roche R, Hinojosa Y, Guzman MG. First dengue haemorrhagic fever epidemic in the Americas, 1981: insights into the causative agent. Arch Virol. 2014 Dec;159(12):3239-47.
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Disponible la versión digital del libro "Cuba indígena hoy: rostros y ADN"
(Nota en CubaDebate)
