Filogenética

Obtienen genoma de caballo fósil

0

El organismo de mayor antigüedad hasta ahora secuenciado, un caballo encontrado en los hielos permanentes del Yukón canadiense y datado entre 560 000 y 780 000 años, ha revelado que los equinos tuvieron un ancestro común hace unos cuatro millones de años. La descripción completa es publicada en Orlando L, Ginolhac A, Zhang G, Froese D, Albrechtsen A, Stiller M, et al. Recalibrating Equus evolution using the genome sequence of an early Middle Pleistocene horse. Nature 04 July 2013;499:74–78.

Filed under Filogenética, Otros Proyectos Genoma by on . Comment. #

Nuevos hallazgos sobre cólera en Haití

0

La secuenciación de varias muestras de Vibrio cholerae obtenidas de diferentes sitios y momentos del brote iniciado en Haití en el 2010 he permitido identificar la limitada capacidad del agente para adquirir nuevos genes del ambiente y para la transferencia horizontal de genes. Acceda al reporte en Katz LS, Petkau A, Beaulaurier J, Tyler S, Antonova ES, Turnsek MA, et al. Evolutionary Dynamics of Vibrio cholerae O1 following a Single-Source Introduction to Haiti. mBio 2 July 2013;4(4):e00398-13.

Filed under Diagnóstico, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

M. leprae estable durante diez siglos

0

Un estudio multinacional ha encontrado que la diversidad genética de la bacteria Mycobacterium leprae ha permanecido relativamente estable en los últimos mil años o más. El estudio se basó en restos de 22 esqueletos humanos de la época medieval y es presentado en Schuenemann VJ, Singh P, Mendum TA, Krause-Kyora B, Jäger G, Bos KI, et al. Genome-Wide Comparison of Medieval and Modern Mycobacterium leprae. Science 2013, DOI: 10.1126/science.1238286.

Filed under Diagnóstico, Filogenética, Genómica, Patógenos by on . Comment. #

Cuba: caracterizan genomas de influenza en cerdos

0

El primer reporte de la circulación del virus de la influenza pandémica H1N1/2009 en rebaños de cerdos en Cuba y el análisis filogenético de tres de las cepas detectadas con el objetivo del trabajo Perez LJ, Perera CL, Frias MT, Rouseaux D, Ganges L, Nuñez JI et al. Isolation and complete genomic characterization of pandemic H1N1/2009 influenza viruses from Cuban swine herds. Research in Veterinary Science 2013;94(3):781–788.

Filed under Diagnóstico, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Aborígenes suramericanos tuvieron ancestros polinesios

0

El análisis del ADN mitocondrial de restos de cráneos de indígenas de la etnia Botocudo, ya extinguida en Brasil, ha arrojado la presencia de haplogrupos compartidos con polinesios. Ello aporta elementos acerca de las migraciones que poblaron el continente americano, según se lee en Gonçalves VF, Stenderup J, Rodrigues-Carvalho C, Silva HP, Gonçalves-Dornelas H, Líryo A et al. Identification of Polynesian mtDNA haplogroups in remains of Botocudo Amerindians from Brazil. PNAS April 1, 2013, doi: 10.1073/pnas.1217905110.

Filed under Diagnóstico, Filogenética, Polimorfismos by on . Comment. #

Genoma de pez fósil

0

El genoma del celacanto, un pez que se creía extinto 70 millones de años atrás y fue “redescubierto” en 1938, ha sido secuenciado y sus principales resultados son comentados en Amemiya CT, Alföldi J, Lee AP, Fan S, Philippe H, MacCallum I et al. The African coelacanth genome provides insights into tetrapod evolution. Nature 2013;496:311–316.

Filed under Bioinformática, Diagnóstico, Filogenética, Otros Proyectos Genoma by on . Comment. #

Sorprende diversidad de pediculosis humana

0

La identificación de marcadores microsatélites en el genoma del Pediculus humanus, y su comparación en muestras tomadas de 11 regiones del planeta, ha revelado que los parásitos de América Central están más estrechamente relacionados con los de Asia que con los de América del Norte. Las implicaciones epidemiológicas y antropológicas son comentadas en Ascunce MS et al. Nuclear Genetic Diversity in Human Lice (Pediculus humanus) Reveals Continental Differences and High Inbreeding among Worldwide Populations. PLoS ONE 2013;8(2):e57619.

Filed under Diagnóstico, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Genómica define variantes de meningiomas

0

El análisis del genoma de 300 meningiomas, el tumor cerebral primario más común, ha permitido distinguir varios subtipos de la enfermedad y descubierto mutaciones implicadas en su génesis, que afectan a TRAF7, KLF4 y SMO. Puede acceder al resumen del reporte en Clark VE et al. Genomic Analysis of Non-NF2 Meningiomas Reveals Mutations in TRAF7, KLF4, AKT1, and SMO. Science 2013;339(6123):1077-1080.

Filed under Cáncer, Diagnóstico, Filogenética, Genómica by on . Comment. #

Identifican linaje masculino ancestral

0

El análisis filogenético de polimorfismos en el cromosoma Y de afroamericanos identificó una rama ancestral extremadamente antigua, con una edad estimada de 338 000 años, lo que la ubica antes de los fósiles humanos y los linajes mitocondriales. El hallazgo es comentado en Mendez FL et al. An African American Paternal Lineage Adds an Extremely Ancient Root to the Human Y Chromosome Phylogenetic Tree. The American Journal of Human Genetics 28 February 2013, doi:10.1016/j.ajhg.2013.02.002.

Filed under Filogenética, Polimorfismos, Proyecto Genoma Humano by on . Comment. #

Secuenciación en brote de tuberculosis

0

La secuenciación del genoma completo es superior a las técnicas de genotipado para investigar las epidemias de tuberculosis, en la identificación de cepas específicas, el seguimiento de la evolución de la bacteria, la vigilancia epidemiológica molecular y otras ventajas. El texto completo de un artículo que presenta tales aplicaciones puede ser consultado en Roetzer A et al. Whole Genome Sequencing versus Traditional Genotyping for Investigation of a Mycobacterium tuberculosis Outbreak: A Longitudinal Molecular Epidemiological Study. PLoS Med 2013;10(2):e1001387.

Filed under Diagnóstico, Filogenética, Genómica, Patógenos by on . Comment. #

8 9 10 11 12 13 14