Microbioma

Medicina de precisión, microbiota intestinal y farmacología

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La microbiota intestinal puede afectar la respuesta a algunos fármacos, y es modificada por la acción de otros. Las interacciones entre los medicamentos orales y la microbiota intestinal es abordada en Mousa S, Sarfraz M, Mousa WK. The Interplay between Gut Microbiota and Oral Medications and Its Impact on Advancing Precision Medicine. Metabolites 2023;13(5):674.

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Farmacogenética: aspirina, esquizofrenia, farmacomicrobiómica, ansiedad, antidepresivos

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– Impact of pharmacogenetics on aspirin resistance: a systematic review
– The Progress and Pitfalls of Pharmacogenetics-Based Precision Medicine in Schizophrenia Spectrum Disorders: A Systematic Review and Meta-Analysis
– Integration of pharmacogenomic and pharmacomicrobiomic data for personalized medicine
– Towards precision medicine for anxiety disorders: objective assessment, risk prediction, pharmacogenomics, and repurposed drugs
– Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for CYP2D6, CYP2C19, CYP2B6, SLC6A4, and HTR2A Genotypes and Serotonin Reuptake Inhibitor Antidepressants

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Microambiente tumoral contiene hongos

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La presencia de hongos en muestras diversas de 17 tipos de tumores malignos, su influencia en las respuestas inmunes y el sinergismo con las bacterias locales, podrían significar nuevos caminos en la patogenia y la atención al cáncer. Así se comenta en Narunsky-Haziza L, Sepich-Poore GD, Livyatan I, Asraf O, Martino C, Nejman D, et al. Pan-cancer analyses reveal cancer-type-specific fungal ecologies and bacteriome interactions. Cell, 2022;185(20):3789-3806.e17.

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Farmacogenómica: implementación, influencias del microbioma, herencia de Neandertales

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– The clinically relevant CYP2C8*3 and CYP2C9*2 haplotype is inherited from Neandertals. The Pharmacogenomics Journal, 2022;22:247–249.
– Human Gut Microbiota and Drug Metabolism. Microbial Ecology, 2022; https://doi.org/10.1007/s00248-022-02081-x
– Integrating Pharmacogenomics Into Treatments: Rationales, Current Challenges, and Future Directions. Georgetown Medical Review, 2022; doi:10.52504/001c.37021

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Novedades sobre bases de datos ómicos

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– GMrepo v2: a curated human gut microbiome database with special focus on disease markers and cross-dataset comparison
– OncoDB: an interactive online database for analysis of gene expression and viral infection in cancer
– mBodyMap: a curated database for microbes across human body and their associations with health and diseases
– Genomicus in 2022: comparative tools for thousands of genomes and reconstructed ancestors

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Catálogo de los microbiomas del planeta

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Un catálogo conformado a partir de muestras de entornos naturales y artificiales, así como de hospederos humanos y de otros animales, ha aumentado en 44 % la diversidad filogenética de las bacterias. Esos y otros hallazgos son presentados en Nayfach S, Roux S, Seshadri R, Udwary D, Varghese N, Schulz F, et al. A genomic catalog of Earth’s microbiomes. Nature Biotechnology 2020;

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