Patógenos

Secuencian la más antigua cepa de cólera

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2019 04 15 cholera1916La más antigua cepa de Vibrio cholerae, obtenida de un soldado británico en 1916, durante la Primera Guerra Mundial, ha sido secuenciada. Se ha encontrado que no producía toxina colérica y contenía el gen de resistencia a la penicilina, décadas antes de que el antibiótico se obtuviera. El reporte original aparece en Dorman MJ, Kane L, Domman D, Turnbull JD, Cormie C, Fazal MA, et al. The history, genome and biology of NCTC 30: a non-pandemic Vibrio cholerae isolate from World War One. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2019;286(1900):20182025.

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Comparan genomas de decenas de parásitos

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2018 12 17 wormsLos genomas de 54 especies de parásitos, tanto nemátodos como platelmintos, han sido secuenciados y comparados. Nuevas dianas terapéuticas han sido identificadas, de acuerdo con los autores en International Helminth Genomes Consortium. Comparative genomics of the major parasitic worms. Nature Genetics 2018; http://dx.doi.org/10.1038%2Fs41588-018-0262-1.

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microARN diferencia neumonía bacteriana de otras etiologías

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2018 12 18 - miRNA2Una firma genética basada en microARN discriminó la infección por neumococo de la posible etiología por influenza, en pacientes con diagnóstico de neumonía. Los detalles, en Poore GD, Ko ER, Valente A, Henao R, Sumner K, Hong C, et al. A miRNA Host Response Signature Accurately Discriminates Acute Respiratory Infection Etiologies. Front. Microbiol. 2018;9:2957.

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Avances en papel de H. pylori en cáncer gástrico

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2018 08 07 h pyloriUn estudio de asociación de genoma completo (GWAS, por sus siglas en inglés) con 173 muestras de Helicobacter pylori de pacientes con gastritis o cáncer gástrico llevó a identificar algunos determinantes de virulencia relacionados con la aparición de los tumores malignos. Vea Berthenet E, Yahara K, Thorell K, Pascoe B, Meric G, Mikhail JM, et al. A GWAS on Helicobacter pylori strains points to genetic variants associated with gastric cancer risk. BMC Biology 2018;16:84.

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Colección sobre genómica, inmunidad e infección

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Fotolia_56010833_Subscription_Yearly_XXL.jpgLa revista Genome Medicine ha puesto a disposición de todos sus lectores la colección Genomics of infection and immunity, que muestra los avances que han permitido los enfoques ómicos en la mejor comprensión de la diversidad y las funciones del sistema inmune, así como en el desarrollo de herramientas para monitorear, proteger contra y tratar las enfermedades infecciosas. Entre los artículos incluidos están:
– Human genetic variants and age are the strongest predictors of humoral immune responses to common pathogens and vaccines
– Developing Zika vaccines: the lessons for disease X
– Antifungal immune responses: emerging host–pathogen interactions and translational implications

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Epidemiología genómica de zika, ébola, sífilis y peste bubónica

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2018 06 23 - ebolaLos análisis filogenéticos aclaran y aportan información sobre brotes e infecciones: ébola en África occidental, zika en América Central, la peste bubónica en la Era de Bronze y sífilis. Los detalles en:
– Phylodynamic assessment of intervention strategies for the West African Ebola virus outbreak
– Analysis of 3800-year-old Yersinia pestis genomes suggests Bronze Age origin for bubonic plague
– Genomic Epidemiology Reconstructs the Introduction and Spread of Zika Virus in Central America and Mexico
– Sequence Variation of Rare Outer Membrane Protein ß-Barrel Domains in Clinical Strains Provides Insights into the Evolution of Treponema pallidum subsp. pallidum, the Syphilis Spirochete

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Técnicas moleculares en el estudio del microbioma

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2018 04 25 EIMCLa heterogeneidad del microbioma humano, su relación con la salud y la enfermedad y las técnicas moleculares empleadas en su caracterización, son temáticas abordadas en la revisión del Campo-Moreno R, Alarcón-Cavero T, D’Auria G, Delgado-Palacio S, Ferrer-Martínez M. Microbiota en la salud humana: técnicas de caracterización y transferencia. Enferm Infecc Microbiol Clin 2018;36:241-5.

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Descubren nuevos virus gigantes

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El hallazgo de dos nuevas cepas de Tupanvirus, con un genoma de 1.44-1.51 Mb y el aparato traduccional más grande conocido hasta el momento, es reportado en Abrahão J, Silva L, Santos Silva L, Bou Khalil JY, Rodrigues R, Arantes T, et al. Tailed giant Tupanvirus possesses the most complete translational apparatus of the known virosphere. Nature Communications 2018;9:749.

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Nuevas variantes, mutaciones y asociaciones

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– Demenais F, Margaritte-Jeannin P, Nicolae DL. Multiancestry association study identifies new asthma risk loci that colocalize with immune-cell enhancer marks. Nature Genetics, 2017;50(1):42.
– Roberts ME, Jackson SA, Susswein LR, Zeinomar N, Ma X, Marshall ML, et al. MSH6 and PMS2 germ-line pathogenic variants implicated in Lynch syndrome are associated with breast cancer. Genetics in Medicine, 2018; doi:10.1038/gim.2017.254.
– Moreno-Moral A, Bagnati M, Koturan S, Ko JH, Fonseca C, Harmston N, et al. Changes in macrophage transcriptome associate with systemic sclerosis and mediate GSDMA contribution to disease risk. Annals of the Rheumatic Diseases, 2018; doi: 10.1136/annrheumdis-2017-212454.
– Coll F, Phelan J, Clark TG. Genome-wide analysis of multi- and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis. Nature Genetics, 2018; doi:10.1038/s41588-017-0029-0.

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Virus ébola permanece en semen por más de un año

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2017 10 22 ebolaPor medio de un ensayo de RT-PCR que detecta secuencias específicas del virus ébola, se determinó la presencia del agente en el 15 % de las muestras de semen hasta 18 meses después del alta de pacientes que fueron atendidos en una unidad de tratamiento de la infección en Sierra Leona. Los detalles del hallazgo aparecen en Deen GF, Broutet N, Xu W, Knust B, Sesay FR, McDonald SLR, et al. Ebola RNA Persistence in Semen of Ebola Virus Disease Survivors — Final Report. N Engl J Med 2017; 377:1428-1437.

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