Transcriptómica

Transcriptómica en la covid-19 grave

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La secuenciación de ARN de sangre total en pacientes con covid-19 ha mostrado que la gravedad de la infección se caracterizó por la abundancia de genes de respuesta inflamatoria, muchos relacionados con neutrófilos y macrófagos. Otros detalles aparecen en Jackson H, Rivero I, Broderick C, Habgood-Coote D, D’Souza G, Nichols S, et al. Characterisation of the blood RNA host response underpinning severity in COVID-19 patients. Scientific Reports 2022;12:12216.

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Sexo y edad marcan diferencias en la respuesta inmune

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Por métodos transcriptómicos se encontró que las mujeres tienen más células plasmáticas en circulación, mientras en los hombres aumentan las células NK y marcadores de inflamación. Puede leer al respecto en Zhaohao H, Binyao C, Xiuxing L, He L, Lihui X, Yuehan G, et al. Effects of sex and aging on the immune cell landscape as assessed by single-cell transcriptomic analysis. PNAS August 17, 2021;118(33):e2023216118.

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Transcriptómica identifica fármacos con acción anti-SARS-CoV-2

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Transcriptomics1El haloperidol y la clofazimina están entre los 11 medicamentos con actividad antiviral frente a SARS-CoV-2, a partir de las diferencias en los patrones de expresión génica entre muestras de infectados y controles. El reporte aparece en Le BL, Andreoletti G, Oskotsky T, Vallejo-Gracia A, Rosales R, Yu K, et al. Transcriptomics-based drug repositioning pipeline identifies therapeutic candidates for COVID-19. Scientific Reports 2021;11:12310.

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Peculiaridades ómicas de la placenta humana

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PlacentaBajos niveles de expresión génica, diferencias en la preclampsia y producción local de la proteína FSTL3 (del inglés follistatin-like 3) son algunos de los hallazgos del estudio del transcriptoma de 302 placentas, descritos en Gong S, Gaccioli F, Dopierala J, Sovio U, Cook E, Volders PJ, et al. The RNA landscape of the human placenta in health and disease. Nature Communications. 2021;12:2639.

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microARNs como biomarcadores de enfermedad cardiovascular

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miRNAAl menos cuatro microARNs que pueden detectarse en el plasma sanguíneo permiten diferenciar la disección espontánea de la arteria coronaria del infarto aterotrombótico del miocardio, y arrojan luz sobre la patogenia de la enfermedad. Los detalles en Lozano-Prieto M, Adlam D, García-Guimaraes M, Sanz-García A, Vera-Tomé P, Rivero F, et al. Differential miRNAs in acute spontaneous coronary artery dissection: Pathophysiological insights from a potential biomarker. EBioMedicine. 2021;66:103338.

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Daño genómico en pacientes del accidente de Chernóbil

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Las roturas de la doble hélice de ADN parecen ser los primeros eventos carcinogénicos en pacientes con tumor papilar tiroideo, expuestos a las radiaciones durante el accidente nuclear de Chernóbil. Otros efectos, en el transcriptoma y el epigenoma, son descritos en Morton LM, Karyadi DM, Stewart C, Bogdanova TI, Dawson ET, Steinberg MK, et al. Radiation-related genomic profile of papillary thyroid cancer after the Chernobyl accident. Science 2021:eabg2538.

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Crean atlas molecular del pulmón humano

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Un atlas con los perfiles de expresión génica, a partir de la secuenciación del ARN, describe 58 poblaciones celulares del pulmón humano, incluidas 14 desconocidas hasta ahora. Ello mejorará el estudio de las enfermedades respiratorias, entre otros impactos, según Travaglini KJ, Nabhan AN, Penland L, Sinha R, Gillich A, Sit RV, et al. A molecular cell atlas of the human lung from single-cell RNA sequencing. Nature 2020;587:619–625.

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Identifican marcador de letalidad para ébola

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2020 02 11 EbolaLa inhibición de una precoz expresión génica y la señalización inflamatoria descontrolada, entre otras, son características que se relacionan con un riesgo mayor de muerte por ébola, revelados por perfiles transcriptómicos en ratones. Tal es el reporte en Price A, Okumura A, Haddock E, Feldmann F, Meade-White K, Sharma P, et al. Transcriptional Correlates of Tolerance and Lethality in Mice Predict Ebola Virus Disease Patient Outcomes. Cell Reports 2020;30(6):1702-1713.e6.

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