Bioinformática

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2016 08 15 zikaLa identificación de secuencias características de la familia Flaviviridae y de al menos un compuesto con capacidad de inhibir la actividad de la polimerasa viral son hallazgos divulgados en Fleming AM, Ding Y, Alenko A, Burrows CJ. Zika Virus Genomic RNA Possesses Conserved G-Quadruplexes Characteristic of the Flaviviridae Family. ACS Infect. Dis. 2016, DOI: 10.1021/acsinfecdis.6b00109.

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2016 08 15 ADLa expresión diferenciada de genes puede revelar la vulnerabilidad a la enfermedad de Alzheimer mucho antes de su inicio típico, de acuerdo con Freer R, Sormanni P, Vecchi G, Ciryam P, Dobson CM, Vendruscolo M. A protein homeostasis signature in healthy brains recapitulates tissue vulnerability to Alzheimer’s disease. Science Advances  10 Aug 2016;2(8):e1600947.

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2016 08 15 oncoimmunologyLas herramientas computacionales desarrolladas para el análisis genómico de las interacciones entre el sistema inmunitario y las células tumorales son revisadas en Hackl H, Charoentong P, Finotello F, Trajanoski Z. Computational genomics tools for dissecting tumour–immune cell interactions. Nature Reviews Genetics 2016;17:441–458.

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160723 RAEl análisis de datos de microarreglos y de varias bases de datos condujo a la identificación de marcadores genéticos relacionados con el desarrollo de la artritis reumatoidea, y otros para la osteoartritis. El artículo original es He P, Zhang Z, Liao W, Xu D, Fu M, Kang Y. Screening of gene signatures for rheumatoid arthritis and osteoarthritis based on bioinformatics analysis. Molecular Medicine Reports 2016;14(2):1587-1593.

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160723 InfluenzaLa selección e inclusión de epítopes conservados e inmunogénicos del virus A de la influenza en una vacuna puede ser un camino para la protección universal frente a la infección. Así se propone en Sheikh QM, Gatherer D, Reche PA, Flower DR. Towards the Knowledge-based Design of Universal Influenza Epitope Ensemble Vaccines. Bioinformatics 2016; doi: 10.1093/bioinformatics/btw399.

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DengueEl análisis filogenético de las secuencias del virus del dengue de la primera epidemia en Cuba con aislamiento viral, de 1977, identificó al genotipo I como variante circulante por primera vez en América Latina y el Caribe. Así se presenta en Díaz Gutiérrez G, Rodríguez-Roche R, Guzmán Tirado M. Relación genética del virus dengue 1 aislado en Cuba durante la epidemia de 1977. Revista Cubana de Medicina Tropical, Norteamérica, may. 2016;68.

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PHGKBPublic Health Genomics Knowledge Base (PHGKB) es un recurso de información para investigadores, decisores, médicos y el público sobre el complicado panorama de la genómica y la salud pública. Es presentado en Yu W, Gwinn M, Dotson WD, Fisk Green R, Clyne M, Wulf A, et al. A knowledge base for tracking the impact of genomics on population health. Genetics in Medicine 2016; doi:10.1038/gim.2016.63.