Filogenética

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Un sublinaje del serotipo dengue III, denominado 3III_B.3, ha sido identificado como una variante de reciente introducción en Cuba, en muestras de pacientes con infección confirmada, tomadas en todas las provincias entre los años 2022 y 2023. La relevancia de un sistema de monitoreo genómico para el dengue es destacada en Pérez M, Álvarez M, Perez L, Benitez AJ, Serrano S, Ribeiro Adelino TE, et al. Establishing a dengue genomic monitoring in Cuba: uncovering virus dynamics to enhance local response. IJID Reg. 2025 Jun 13;16:100683.

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El más hermoso y colorido de los caracoles es Polymita picta, la polimita cubana,  una especie en peligro de extinción. Su genoma mitocondrial ha sido secuenciado y aparece en Lewis AM, Reyes-Tur B, Davison A. The mitochondrial genome and phylogenetic placement of the world’s most beautiful snail, Polymita picta. Journal of Molluscan Studies, June 2025;91(2):eyaf006.

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Una especie de tarántula, la de mayor tamaño del género Trichopelma, ha sido encontrada en Viñales, Cuba, y parece ser única, de acuerdo con el análisis filogenómico y las características fenotípicas. Así se reporta en Ortiz D, Fonseca E. A hairy giant among dwarves: Trichopelma grande, a distinct new species of tarantula from Cuba (Araneae: Theraphosidae). Journal of Natural History, 2024;58(45-48):2189-2205.

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Una serie de artículos aparecidos esta semana reportan la secuencación de 233 especies de las 16 familias de primates no humanos. Las repercusiones para la conservación de estos animales, las relaciones con el genoma humano y el origen de las estructuras sociales, son comentadas en Lewis D. Biggest ever study of primate genomes has surprises for humanity. Nature, 2023; doi: https://doi.org/10.1038/d41586-023-01776-6.

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La secuenciación de ADN ambiental en un sitio del norte de Groenlandia ha revelado la existencia en ese lugar, hace dos millones de años de especies vegetales y animales, tanto marinas como terrestres, entre ellas mastodontes, ciervos, roedores y gansos. Los detalles, en Kjær KH, Pedersen MW, De Sanctis B, De Cahsan B, Korneliussen TS, Michelsen CS, et al. A 2-million-year-old ecosystem in Greenland uncovered by environmental DNA. Nature, 2022;612:283–291.

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El análisis de aislamientos, en pacientes cubanos, del genoma del Treponema pallidum subsp. endemicum, agente causal del bejel o sífilis endémica, ha revelado evidencias que sugieren una infección persistente, más que un brote a partir de un caso importado, de acuerdo con Vrbová E, Noda AA, Grillová L, Rodríguez I, Forsyth A, Oppelt J, et al. Whole genome sequences of Treponema pallidum subsp. endemicum isolated from Cuban patients: The non-clonal character of isolates suggests a persistent human infection rather than a single outbreak. PLoS Negl Trop Dis. 2022 Jun 10;16(6):e0009900.

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Un nuevo algoritmo inferencial ha revelado que solo entre 1.5 y 7 % del genoma humano moderno es exclusivamente humano, y que en los últimos 600000 años han ocurrido cambios adaptativos en genes relacionados con el desarrollo y las funciones del cerebro. Los detalles en Schaefer NK, Shapiro B, Green RE. An ancestral recombination graph of human, Neanderthal, and Denisovan genomes. Science Advances. 2021;7(29):eabc0776.

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TBMuestras pulmonares obtenidas por cirugía de pacientes tuberculosos tuvieron un 40 % de infecciones por al menos dos cepas no relacionadas, a partir de la secuenciación genómica, lo que puede pasar inadvertido en muestras de esputo. Las implicaciones clínicas son discutidas en Moreno-Molina M, Shubladze N, Khurtsilava I, Avaliani Z, Bablishvili N, Torres-Puente M, et al. Genomic analyses of Mycobacterium tuberculosis from human lung resections reveal a high frequency of polyclonal infections. Nature Communications. 2021;12:2716.