Filogenética

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2017 06 24 MommiesEl estudio de los genomas de tres momias egipcias datadas de un periodo de 1300 años, ha revelado que los pobladores del antiguo Egipto compartían más similitudes genéticas con los habitantes del Cercano Oriente que con los egipcios actuales. Tales son las conclusiones aparecidas en Schuenemann VJ, Peltzer A, Welte B, van Pelt WP, Molak M, Wang CC, et al. Ancient Egyptian mummy genomes suggest an increase of Sub-Saharan African ancestry in post-Roman periods. Nature Communications 2017;8:15694.

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2017 06 24 Giant virusUn nuevo grupo de virus gigantes, denominado como Klosneuviruses, ha sido descubierto en datos metagenómicos. No parece que evolucionaran a partir de un ancestro celular sino de otros virus más pequeños. Puede leer el original en Schulz F, Yutin N, Ivanova NN, Ortega DR, Lee TK, Vierheilig J, et al. Giant viruses with an expanded complement of translation system components. Science  2017;356(6333):82-85.

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2017 04 16 AedesLa secuenciación del exoma de mosquitos de A. aegypti coleccionados en cinco diferentes locaciones del mundo ha revelado que la especie habitante en la costa occidental de África migró hacia América y Asia. El estudio aparece en Crawford JE, Alves JM, Palmer WJ, Day JP, Sylla M, Ramasamy R, et al. Population genomics reveals that an anthropophilic population of Aedes aegypti mosquitoes in West Africa recently gave rise to American and Asian populations of this major disease vector. BMC Biology 2017;15:16.

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2017 04 16 AspergillusLos resultados de la comparación filogenética de cinco especies de hongos del género Aspergillus, y el análisis de sus implicaciones industriales y médicas, son presentados en de Vries RP, Riley R, Wiebenga A, Aguilar-Osorio G, Amillis S, Uchima CA, et al. Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus. Genome Biology 2017;18:28.

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El seguimiento a una bacteria resistente a vancomicina aparece en Raven KE, Gouliouris T, Brodrick H, Coll F, Brown NM, Reynolds R, et al. Complex Routes of Nosocomial Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium Transmission Revealed by Genome Sequencing. Clin Infect Dis 2017 ciw872. doi: 10.1093/cid/ciw872.
2017 02 24 H pyloriPuede leer sobre la evolución de la infección por Helicobacter pylori en las Américas en Thorell K, Yahara K, Berthenet E, Lawson DJ, Mikhail J, Kato I, et al. Rapid evolution of distinct Helicobacter pylori subpopulations in the Americas. PLoS Genet 2017;13(2):e1006546.

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2017 02 24 begomovirusLas secuencias genómicas completas de dos nuevos miembros del género Begomovirus, que infectan el frijol común (Phaseolus vulgaris) en Cuba, han sido reportadas y propuestas su denominación como virus del mosaico severo y virus del moteado del frijol común. Los detalles son descritos en Chang-Sidorchuk L, González-Alvarez H, Navas-Castillo J, Fiallo-Olivé E, Martínez-Zubiaur Y. Complete genome sequences of two novel bipartite begomoviruses infecting common bean in Cuba. Arch Virol. 2017 Feb 6. doi: 10.1007/s00705-016-3209-9.

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CB_Fig2La secuenciación de una cepa antigua de virus variólico y su comparación con muestras más recientes ha mostrado que la diversificación del agente ha ocurrido en los últimos siglos, junto a la vacunación. Lea los detalles en Duggan AT, Perdomo MF, Piombino-Mascali D, Marciniak S, Poinar D, Emery MV, et al. 17th Century Variola Virus Reveals the Recent History of Smallpox. Current Biology 2016; http://dx.doi.org/10.1016/j.cub.2016.10.061.

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Lieberman TDLas peculiaridades de la migración del Mycobacterium tuberculosis entre órganos de individuos con vih son divulgadas en Lieberman TD, Wilson D, Misra R, Xiong LL, Moodley P, Cohen T, et al. Genomic diversity in autopsy samples reveals within-host dissemination of HIV-associated Mycobacterium tuberculosis. Nature Medicine 2016; doi:10.1038/nm.4205. Mientras, la distribución global de una cepa de la bacteria es dilucidada en Stucki D, Brites D, Jeljeli L, Coscolla M, Liu Q, Trauner A, et al. Mycobacterium tuberculosis lineage 4 comprises globally distributed and geographically restricted sublineages. Nature Genetics 2016; doi:10.1038/ng.3704.

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E. SienaLas evidencias sobre la diversidad fenotípica y los mecanismos genéticos subyacentes en la bacteria Neisseria meningitidis han sido reforzadas a partir de la secuenciación y comparación genómicas de colonias obtenidas en condiciones poco selectivas. Los hallazgos aparecen en Siena E, D’Aurizio R, Riley D, Tettelin H, Guidotti S, Torricelli G, et al. In-silico prediction and deep-DNA sequencing validation indicate phase variation in 115 Neisseria meningitidis genes. BMC Genomics 2016;17:843.

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E. C. HolmesEl análisis de las secuencias genómicas de muestras de virus Ébola arroja luz sobre los orígenes, la evolución y la diseminación del agente durante el brote 2013-2016 en África. Lea los detalles en Holmes EC, Dudas G, Rambaut A, Andersen KG. The evolution of Ebola virus: Insights from the 2013–2016 epidemic. Nature 2016;538:193–200.