Patógenos

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Un estudio multinacional ha encontrado que la diversidad genética de la bacteria Mycobacterium leprae ha permanecido relativamente estable en los últimos mil años o más. El estudio se basó en restos de 22 esqueletos humanos de la época medieval y es presentado en Schuenemann VJ, Singh P, Mendum TA, Krause-Kyora B, Jäger G, Bos KI, et al. Genome-Wide Comparison of Medieval and Modern Mycobacterium leprae. Science 2013, DOI: 10.1126/science.1238286.

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La identificación de péptidos derivados de Chlamydia trachomatis por métodos bioinformáticos permitió el desarrollo de ensayos serológicos para el estudio de la infertilidad femenina. Esta “prueba de concepto” es presentada en Stansfielda SH, Patela P, Debattistab J, Armitagea CW, Cunninghama K, Timmsa P et al. Proof of concept: A bioinformatic and serological screening method for identifying new peptide antigens for Chlamydia trachomatis related sequelae in women. Results in
Immunology 2013;3:33–39.

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El primer reporte de la circulación del virus de la influenza pandémica H1N1/2009 en rebaños de cerdos en Cuba y el análisis filogenético de tres de las cepas detectadas con el objetivo del trabajo Perez LJ, Perera CL, Frias MT, Rouseaux D, Ganges L, Nuñez JI et al. Isolation and complete genomic characterization of pandemic H1N1/2009 influenza viruses from Cuban swine herds. Research in Veterinary Science 2013;94(3):781–788.

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La secuenciación del genoma de cepas bacterianas ha confirmado que es posible la transmisión zoonótica de patógenos resistentes a antibióticos. El estudio de dos brotes de Staphylococcus aureus resistentes a meticilina es comentado en Harrison EM, Paterson GK, Holden MTG, Larsen J, Stegger M, Larsen AR et al. Whole genome sequencing identifies zoonotic transmission of MRSA isolates with the novel mecA homologue mecC. EMBO Molecular Medicine 2013;5(4):509–515.

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La identificación de marcadores microsatélites en el genoma del Pediculus humanus, y su comparación en muestras tomadas de 11 regiones del planeta, ha revelado que los parásitos de América Central están más estrechamente relacionados con los de Asia que con los de América del Norte. Las implicaciones epidemiológicas y antropológicas son comentadas en Ascunce MS et al. Nuclear Genetic Diversity in Human Lice (Pediculus humanus) Reveals Continental Differences and High Inbreeding among Worldwide Populations. PLoS ONE 2013;8(2):e57619.

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El Instituto Nacional de Alergia y Enfermedades Infecciosas (NIAID por su siglas en inglés) de los Estados Unidos ha abierto una convocatoria para financiar la creación de centros de genómica para las enfermedades infecciosas. La iniciativa aportará hasta US$ 14 millones para la apertura de dos o tres instituciones que combinen la secuenciación, la identificación de polimorfismos, la expresión génica, el análisis bioinformático, entre otros. La convocatoria puede ser aquí.

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La secuenciación del genoma completo es superior a las técnicas de genotipado para investigar las epidemias de tuberculosis, en la identificación de cepas específicas, el seguimiento de la evolución de la bacteria, la vigilancia epidemiológica molecular y otras ventajas. El texto completo de un artículo que presenta tales aplicaciones puede ser consultado en Roetzer A et al. Whole Genome Sequencing versus Traditional Genotyping for Investigation of a Mycobacterium tuberculosis Outbreak: A Longitudinal Molecular Epidemiological Study. PLoS Med 2013;10(2):e1001387.

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La secuenciación del genoma de las comunidades bacterianas obtenidas de placas calcificadas en dientes antiguos ha mostrado que las bacterias cariogénicas pasaron a ser dominantes a partir de la Revolución Industrial y que los ecosistemas orales son ahora menos diversos, probablemente por los cambios en la dieta y otros estilos de vida. Lea el reporte completo en Adler CJ et al. Sequencing ancient calcified dental plaque shows changes in oral microbiota with dietary shifts of the Neolithic and Industrial revolutions. Nature Genetics 2013 doi:10.1038/ng.2536.

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La construcción de árboles filogenéticos de hantavirus, causantes de importantes zoonosis en el humano, ha conducido a la hipótesis de que estos patógenos podrían haber emergido en los murciélagos antes de establecerse en los roedores. Tal descubrimiento, y el hallazgo de cuatro nuevas cepas de estos virus, aparecen en Guo W-P et al. Phylogeny and Origins of Hantaviruses Harbored by Bats, Insectivores, and Rodents. PLoS Pathog 2013;9(2):e1003159.

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Varias muestras de aire tomadas a alturas entre ocho y diez kilómetros en la troposfera del Mar Caribe y regiones cercanas fueron caracterizadas con técnicas genómicas, tras lo cual se encontró que las bacterias constituyen el 20 % de las partículas con diámetros entre 0,25 y 1 micrómetros. Puede leer el reporte presentado en PNAS 2013 Jan 28.