Bases de datos

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2016 09 30 HUGOLas posibilidades de visualización, búsqueda y descarga de datos sobre las familias de genes, de acuerdo con el nuevo rediseño de The HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC), son explicadas en el reporte Gray KA, Seal RL, Tweedie S, Wright MW, Bruford EA. A review of the new HGNC gene family resource. Human Genomics 2016;10:6.

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2016 09 30 TGDUn incremento de la tercera parte de los datos, con relación a 2015, es el resultado de la reciente actualización de The Comparative Toxicogenomics Database, especializada en las interacciones entre las sustancias químicas y los productos génicos. Sus avances son comentados en Davis AP, Grondin CJ, Johnson RJ, Sciaky D, King BL, McMorran R, et al. The Comparative Toxicogenomics Database: update 2017. Nucl. Acids Res. 2016; doi: 10.1093/nar/gkw838.

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160723 RAEl análisis de datos de microarreglos y de varias bases de datos condujo a la identificación de marcadores genéticos relacionados con el desarrollo de la artritis reumatoidea, y otros para la osteoartritis. El artículo original es He P, Zhang Z, Liao W, Xu D, Fu M, Kang Y. Screening of gene signatures for rheumatoid arthritis and osteoarthritis based on bioinformatics analysis. Molecular Medicine Reports 2016;14(2):1587-1593.

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Global AllianceLa Alianza Global para la Genómica y la Salud propone que los datos genómicos, aunque se compartan y estén disponibles en múltiples bases de datos, deben mantenerse controlados desde los sitios donde originalmente se obtienen. Lea la propuesta en The Global Alliance for Genomics and Health. A federated ecosystem for sharing genomic, clinical data. Science  10 Jun 2016;352(6291):1278-1280.

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PHGKBPublic Health Genomics Knowledge Base (PHGKB) es un recurso de información para investigadores, decisores, médicos y el público sobre el complicado panorama de la genómica y la salud pública. Es presentado en Yu W, Gwinn M, Dotson WD, Fisk Green R, Clyne M, Wulf A, et al. A knowledge base for tracking the impact of genomics on population health. Genetics in Medicine 2016; doi:10.1038/gim.2016.63.

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2016 05 21 - seq costsCon la reducción de los costos de la secuenciación y el incremento en la generación de datos se requiere de nuevos paradigmas para el almacenamiento y análisis de los resultados experimentales. Así opinan en Muir P, Li S, Lou S, Wang D, Spakowicz DJ, Salichos L, et al. The real cost of sequencing: scaling computation to keep pace with data generation. Genome Biology 2016;17:53.

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2016 04 09 CostsLa progresiva reducción de los costos de la secuenciación del genoma ha provocado una explosión en la generación de datos, y una creciente demanda de los servicios bioinformáticos. Tal es el tema a debate en Muir P, Li S, Lou S, Wang D, Spakowicz DJ, Salichos L, et al. The real cost of sequencing: scaling computation to keep pace with data generation. Genome Biology 2016;17:53.

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NAR DBLa revista Nucleic Acids Research, como cada año, publicó desde enero su número especial Database, que actualiza sobre las nuevas o mejoradas bases de datos de información biológica. El editorial es Rigden DJ, Fernández-Suárez XM, Galperin MY. The 2016 database issue of Nucleic Acids Research and an updated molecular biology database collection. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D1-6.