Filogenética

Genómica distingue cepas de salmonella

0

16Una variante de Salmonella enteritidis relacionada con gastroenteritis y otras dos, ubicadas sobre todo en África, responsables de infección resistente a múltiples drogas y con capacidad de diseminación sanguínea, han sido identificadas por secuenciación del genoma completo de cientos de muestras. Lea al respecto en Feasey NA, Hadfield J, Keddy KH, Dallman TJ, Jacobs J, Deng X, et al. Distinct Salmonella Enteritidis lineages associated with enterocolitis in high-income settings and invasive disease in low-income settings. Nature Genetics 2016; doi:10.1038/ng.3644.

Filed under Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Epidemiología molecular de estafilococo resistente

0

5La emergencia y diseminación de una cepa de estafilococo dorado resistente a meticilina, así como su asociación a las prácticas de uso de antibióticos, son resultados del análisis de secuencias genómicas de muestras de cuatro continentes, tal como aparece en Ward MJ, Goncheva M, Richardson E, McAdam PR, Raftis E, Kearns A, et al. Identification of source and sink populations for the emergence and global spread of the East-Asia clone of community-associated MRSA. Genome Biology 2016;17:160.

Filed under Diagnóstico, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Revelaciones del genoma del zika

0

2016 08 15 zikaLa identificación de secuencias características de la familia Flaviviridae y de al menos un compuesto con capacidad de inhibir la actividad de la polimerasa viral son hallazgos divulgados en Fleming AM, Ding Y, Alenko A, Burrows CJ. Zika Virus Genomic RNA Possesses Conserved G-Quadruplexes Characteristic of the Flaviviridae Family. ACS Infect. Dis. 2016, DOI: 10.1021/acsinfecdis.6b00109.

Filed under Bioinformática, Filogenética, Patógenos, Tratamientos by on . Comment. #

Otras aplicaciones genómicas en epidemiología

0

160723 EpidemiolLea los siguientes reportes:
– Whole-Genome Sequencing for Routine Pathogen Surveillance in Public Health: a Population Snapshot of Invasive Staphylococcus aureus in Europe
– Genomic Analysis and Comparison of Two Gonorrhea Outbreaks
– Worldwide Phylogenetic Distributions and Population Dynamics of the Genus Histoplasma

Filed under Bioinformática, Diagnóstico, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Estudian virus dengue cuarenta años después

0

DengueEl análisis filogenético de las secuencias del virus del dengue de la primera epidemia en Cuba con aislamiento viral, de 1977, identificó al genotipo I como variante circulante por primera vez en América Latina y el Caribe. Así se presenta en Díaz Gutiérrez G, Rodríguez-Roche R, Guzmán Tirado M. Relación genética del virus dengue 1 aislado en Cuba durante la epidemia de 1977. Revista Cubana de Medicina Tropical, Norteamérica, may. 2016;68.

Filed under Bioinformática, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

La muerte negra y la peste moderna

0

2016 06 12 - PlagueLas pandemias de muerte negra que asolaron Europa desde la antigüedad, causadas por Yersinia pestis, fueron la fuente para los brotes modernos de la enfermedad, de acuerdo con un estudio filogenético publicado en Spyrou MA, Tukhbatova RI, Feldman M, Drath J, Kacki S, Beltrán de Heredia J, et al. Historical Y. pestis Genomes Reveal the European Black Death as the Source of Ancient and Modern Plague Pandemics. Cell Host & Microbe 8 June 2016;19(6):874–881.

Filed under Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Evolución de patógeno en paciente con fibrosis quística

0

2016 06 12 - CFLa evolución genómica y funcional de la infección pulmonar por Burkholderia multivorans en un enfermo de fibrosis quística durante 20 años es descrita en Silva IN, Santos PM, Santos MR, Zlosnik JEA, Speert DP, Buskirk SW, et al. Long-Term Evolution of Burkholderia multivorans during a Chronic Cystic Fibrosis Infection Reveals Shifting Forces of Selection. mSystems 2016; DOI: 10.1128/mSystems.00029-16.

Filed under Bioinformática, Defectos congénitos, Diagnóstico, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Estudian cepas de zika en todo el mundo

0

2016 05 21 - mosquito to humanEl análisis filogenético de 41 cepas de virus zika de América del Sur, Polinesia, Malasia y Nigeria reveló cambios en una proteína que podrían alterar su virulencia. Los hallazgos al respecto son presentados en Wang L, Valderramos SG, Wu A, Ouyang S, Li C, Brasil P, et al. From Mosquitos to Humans: Genetic Evolution of Zika Virus. Cell Host and Microbe 2016;19(5):561–565.

Filed under Bioinformática, Diagnóstico, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

Poblamiento de las Américas, según los genes

0

2016 04 09 Americas 1La secuenciación y el análisis filogenético del ADN mitocondrial de restos humanos precolombinos sugieren la entrada de humanos por el estrecho de Bering a partir de poblaciones de Siberia oriental. Otros detalles se revelan en Llamas B, Fehren-Schmitz L, Valverde G, Soubrier J, Mallick S, Rohland N, et al. Ancient mitochondrial DNA provides high-resolution time scale of the peopling of the Americas. Science Advances 01 Apr 2016;2(4):e1501385.

Filed under Bioinformática, Filogenética, Genómica by on . Comment. #

Análisis genómico arroja más detalles sobre zika

0

2016 04 09 zikaLos análisis filogenéticos sugieren una única introducción del virus del zika en las Américas, así como sus vías de diseminación a partir de Brasil. Estos y otros hallazgos son descritos en Rodrigues Faria N, do Socorro R, Kraemer MUG, Souza R, Sequetin Cunha M, Hill SC, et al. Zika virus in the Americas: Early epidemiological and genetic findings. Science  24 Mar 2016; DOI: 10.1126/science.aaf5036.

Filed under Bioinformática, Filogenética, Patógenos by on . Comment. #

2 3 4 5 6 7 8