Una serie de artículos aparecidos esta semana reportan la secuencación de 233 especies de las 16 familias de primates no humanos. Las repercusiones para la conservación de estos animales, las relaciones con el genoma humano y el origen de las estructuras sociales, son comentadas en Lewis D. Biggest ever study of primate genomes has surprises for humanity. Nature, 2023; doi: https://doi.org/10.1038/d41586-023-01776-6.
La propuesta de “de-extinguir” al dodo, ave no voladora desaparecida en el siglo XVII por la depredación humana, implica retos tecnológicos y ecológicos. Estas y otras consideraciones son abordadas en Callaway E. What it would take to bring back the dodo. Nature, 2023; https://doi.org/10.1038/d41586-023-00379-5.
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El Premio Nobel de Fisiología o Medicina 2022 ha sido otorgado al investigador sueco Svante Pääbo, por la obtención del genoma del neandertal, lo que dio origen a la paleogenómica. Su grupo de trabajo también secuenció el genoma de los homínidos denisovianos y descubrió la transferencia de material genético de esas especies extintas al Homo sapiens. A propósito del premio, les proponemos algunos artículos relevantes de Pääbo: Read more on Nobel 2022 en Medicina: paleogenómica…
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Tiomargarita magnifica es una bacteria que puede superar el centímetro de longitud, lo que la hace visible al ojo humano, con un genoma de más de 11000 genes que no está libre en el citoplasma. El hallazgo es reportado en Volland JM, Gonzalez-Rizzo S, Gros O, Tyml T, Ivanova N, Schulz F, et al. A centimeter-long bacterium with DNA compartmentalized in membrane-bound organelle. bioRxiv, 2022; https://doi.org/10.1101/2022.02.16.480423.
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Con el objetivo de secuenciar, catalogar y caracterizar los genomas de toda la biodiversidad eucariótica del planeta, en un periodo de diez años, ha sido lanzado el Proyecto BioGenoma de la Tierra (en inglés, Earth BioGenome Project – EBP). Un comentario al respecto puede ser consultado en Lewin HA, Robinson GE, Kress WJ, Baker WJ, Coddington J, Crandall KA, et al. Earth BioGenome Project: Sequencing life for the future of life. PNAS, 2022;119(4).
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Más de tres mil especies animales, con predominio de vertebrados, han sido secuenciadas hasta el momento y sus genomas están disponibles en la base de datos GenBank. El tema es abordado en Hotaling S, Kelley JL, Frandsen PB. Toward a genome sequence for every animal: Where are we now? PNAS December 28, 2021;118(52):e2109019118.
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El número de genomas de la microbiota intestinal humana ha ascendido a 204938, que codifican para más de 170 millones de secuencias proteicas, según dos colecciones unificadas. Más del 70 % de las especies no ha sido cultivado, y el 40 % de las proteínas carece de anotaciones funcionales, según Almeida A, Nayfach S, Boland M, Strozzi F, Beracochea M, Shi ZJ, et al. A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome. Nature Biotechnology, 2020; https://doi.org/10.1038/s41587-020-0603-3.
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Los genomas de 54 especies de parásitos, tanto nemátodos como platelmintos, han sido secuenciados y comparados. Nuevas dianas terapéuticas han sido identificadas, de acuerdo con los autores en International Helminth Genomes Consortium. Comparative genomics of the major parasitic worms. Nature Genetics 2018; http://dx.doi.org/10.1038%2Fs41588-018-0262-1.
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La heterogeneidad del microbioma humano, su relación con la salud y la enfermedad y las técnicas moleculares empleadas en su caracterización, son temáticas abordadas en la revisión del Campo-Moreno R, Alarcón-Cavero T, D’Auria G, Delgado-Palacio S, Ferrer-Martínez M. Microbiota en la salud humana: técnicas de caracterización y transferencia. Enferm Infecc Microbiol Clin 2018;36:241-5.
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El diseño de un genoma mínimo de 473 genes y su síntesis química permitió la generación de una célula bacteriana con replicación autónoma. El resumen de este controversial resultado del equipo de Craig Venter está disponible en Hutchison III CA, Chuang RY, Noskov VN, Assad-Garcia N, Deerinck TJ, Ellisman MH, et al. Design and synthesis of a minimal bacterial genome. Science 25 Mar 2016;351(6280).
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