La edición del genoma ha sido empleada para diseñar y obtener ganado transgénico resistente a la tuberculosis, por medio de la inserción del gen NRAMP1 y la posterior transferencia nuclear en células somáticas. Puede leer al respecto en Gao Y, Wu H, Wang Y, Liu X, Chen L, Li Q, et al. Single Cas9 nickase induced generation of NRAMP1 knockin cattle with reduced off-target effects. Genome Biology 2017;18:13.
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Las secuencias genómicas completas de dos nuevos miembros del género Begomovirus, que infectan el frijol común (Phaseolus vulgaris) en Cuba, han sido reportadas y propuestas su denominación como virus del mosaico severo y virus del moteado del frijol común. Los detalles son descritos en Chang-Sidorchuk L, González-Alvarez H, Navas-Castillo J, Fiallo-Olivé E, Martínez-Zubiaur Y. Complete genome sequences of two novel bipartite begomoviruses infecting common bean in Cuba. Arch Virol. 2017 Feb 6. doi: 10.1007/s00705-016-3209-9.
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Cinco proteínas estructurales y dos no estructurales del virus Zika mostraron actividad citopática en un modelo de levadura: restricción de la proliferación celular, inducción de hipertrofia y activación del estrés oxidativo que lleva a la muerte celular. El reporte puede ser consultado en Li D, Poulsen M, Fenyvuesvolgyi C, Yashiroda Y, Yoshida M, Simard JM, et al. Characterization of cytopathic factors through genome-wide analysis of the Zika viral proteins in fission yeast. PNAS 2017;114(3):E376–E385.
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Virus Variation Resource es una plataforma para el trabajo con secuencias de siete grupos virales: influenza, dengue, del Nilo occidental, ébola, MERS, rotavirus A y zika. Sus características se resumen en Hatcher EL, Zhdanov SA, Bao Y, Blinkova O, Nawrocki EP, Ostapchuck Y, et al. Virus Variation Resource – improved response to emergent viral outbreaks. Nucl. Acids Res. (2016) doi: 10.1093/nar/gkw1065.
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La secuenciación de una cepa antigua de virus variólico y su comparación con muestras más recientes ha mostrado que la diversificación del agente ha ocurrido en los últimos siglos, junto a la vacunación. Lea los detalles en Duggan AT, Perdomo MF, Piombino-Mascali D, Marciniak S, Poinar D, Emery MV, et al. 17th Century Variola Virus Reveals the Recent History of Smallpox. Current Biology 2016; http://dx.doi.org/10.1016/j.cub.2016.10.061.
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La secuenciación del exoma completo de cepas de E. coli reveló el papel del fago VT2f en el riesgo de ocurrencia de síndrome hemolítico urémico, según aparece en Grande L, Michelacci V, Bondì R, Gigliucci F, Franz E, Badouei M, et al. Whole-Genome Characterization and Strain Comparison of VT2f-Producing Escherichia coli Causing Hemolytic Uremic Syndrome. Emerg Infect Dis. 2016;22(12):2078-2086.
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Las peculiaridades de la migración del Mycobacterium tuberculosis entre órganos de individuos con vih son divulgadas en Lieberman TD, Wilson D, Misra R, Xiong LL, Moodley P, Cohen T, et al. Genomic diversity in autopsy samples reveals within-host dissemination of HIV-associated Mycobacterium tuberculosis. Nature Medicine 2016; doi:10.1038/nm.4205. Mientras, la distribución global de una cepa de la bacteria es dilucidada en Stucki D, Brites D, Jeljeli L, Coscolla M, Liu Q, Trauner A, et al. Mycobacterium tuberculosis lineage 4 comprises globally distributed and geographically restricted sublineages. Nature Genetics 2016; doi:10.1038/ng.3704.
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A partir de muestras colectadas en más de 700 hogares en todo Estados Unidos, se ha abordado por medio de la secuenciación la diversidad y los potenciales riesgos para la salud humana de los artrópodos que habitan en las casas. Así se presenta en Madden AA, Barberán A, Bertone MA, Menninger HL, Dunn RR, Fierer N, et al. The diversity of arthropods in homes across the United States as determined by environmental DNA analyses. Molecular Ecology2016;25(21).
Las evidencias sobre la diversidad fenotípica y los mecanismos genéticos subyacentes en la bacteria Neisseria meningitidis han sido reforzadas a partir de la secuenciación y comparación genómicas de colonias obtenidas en condiciones poco selectivas. Los hallazgos aparecen en Siena E, D’Aurizio R, Riley D, Tettelin H, Guidotti S, Torricelli G, et al. In-silico prediction and deep-DNA sequencing validation indicate phase variation in 115 Neisseria meningitidis genes. BMC Genomics 2016;17:843.
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El análisis de las secuencias genómicas de muestras de virus Ébola arroja luz sobre los orígenes, la evolución y la diseminación del agente durante el brote 2013-2016 en África. Lea los detalles en Holmes EC, Dudas G, Rambaut A, Andersen KG. The evolution of Ebola virus: Insights from the 2013–2016 epidemic. Nature 2016;538:193–200.
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Disponible la versión digital del libro "Cuba indígena hoy: rostros y ADN"
(Nota en CubaDebate)
